197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2616 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  100 
 
 		 315 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  84.08 
 
 		 317 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  83.76 
 
 		 340 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  78.8 
 
 		 318 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  67.72 
 
 		 317 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  50.49 
 
 		 318 aa  299  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  45.51 
 
 		 320 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  45.22 
 
 		 320 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  44.9 
 
 		 320 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7177  Auxin Efflux Carrier  47.91 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  32.15 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  32.59 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  32.59 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  31.31 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  30.97 
 
 		 312 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  35.14 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  30.72 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  31.94 
 
 		 314 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  33.55 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  29.9 
 
 		 313 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  32.71 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  28.81 
 
 		 307 aa  105  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  30.74 
 
 		 330 aa  105  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  31.86 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  29.45 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  27.04 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  29.36 
 
 		 321 aa  102  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  32.37 
 
 		 311 aa  102  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  28.21 
 
 		 313 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  30.2 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  29.64 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  29.72 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  31.31 
 
 		 311 aa  99.8  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  28.3 
 
 		 318 aa  99.4  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  28.3 
 
 		 318 aa  99  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  27.54 
 
 		 315 aa  99  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  29.94 
 
 		 313 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  29.53 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  29.34 
 
 		 317 aa  97.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  28.43 
 
 		 313 aa  96.3  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  24.61 
 
 		 332 aa  95.9  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  29.43 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  27.04 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  25.97 
 
 		 318 aa  93.6  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.3 
 
 		 318 aa  93.6  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  25.97 
 
 		 318 aa  93.6  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  28.77 
 
 		 318 aa  93.2  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  28.48 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  28.3 
 
 		 315 aa  90.1  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  23.23 
 
 		 322 aa  88.2  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  23.4 
 
 		 320 aa  87  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  21.43 
 
 		 319 aa  86.7  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  23.08 
 
 		 320 aa  85.9  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  22.98 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  27.56 
 
 		 337 aa  82.4  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  29.3 
 
 		 372 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  29.39 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  21.86 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  24.84 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  21.22 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  29.37 
 
 		 311 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  21.47 
 
 		 320 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  20.9 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  25.86 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  29.55 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  26.97 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  27.59 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  29.52 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  23.78 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  24.52 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  29.75 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  29.7 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  22.68 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  25.62 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  21.04 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49900  permease  27.04 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  22.73 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  25.83 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  24.61 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2077  Auxin Efflux Carrier  26.18 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.393578  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  27.53 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  25.64 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  25.86 
 
 		 322 aa  67  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  26.91 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  25.99 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  25.99 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  27.3 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  25.71 
 
 		 308 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  28.33 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  22.64 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  28.16 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2164  auxin efflux carrier  23.1 
 
 		 321 aa  62  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.232164  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1014  Auxin Efflux Carrier  28.87 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152875  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  25.62 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  24.61 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1197  auxin efflux carrier  22.82 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.793167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  24.44 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  26.91 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2509  putative transporter YfdV  25.88 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.122299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>