More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3242 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 301 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  60.96 
 
 		 297 aa  332  4e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  60.96 
 
 		 297 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  48.97 
 
 		 302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  45.05 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  42.35 
 
 		 312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  34.98 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  35.74 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  31.16 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  29.69 
 
 		 296 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  32.85 
 
 		 310 aa  109  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  29.35 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  28.62 
 
 		 291 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3176  auxin efflux carrier  31.73 
 
 		 310 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  28.26 
 
 		 306 aa  99.4  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  29.8 
 
 		 322 aa  99  9e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  30.28 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  28.28 
 
 		 291 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  27.81 
 
 		 325 aa  95.9  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  29.07 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2903  auxin efflux carrier  27.62 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.788833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  32.87 
 
 		 301 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  29.48 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4185  auxin efflux carrier  26.12 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1602  auxin efflux carrier  29.87 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  27.73 
 
 		 291 aa  89  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  27.82 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  27.82 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  30.73 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  25.68 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  28.92 
 
 		 305 aa  86.7  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  27.82 
 
 		 305 aa  86.3  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  27.82 
 
 		 305 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  28.52 
 
 		 305 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2172  hypothetical protein  28.27 
 
 		 305 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  27.08 
 
 		 295 aa  85.5  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  27.82 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  29.54 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  27.95 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23880  membrane protein  33.18 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  27.6 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  26.99 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1052  auxin efflux carrier  27.87 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.951846  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  32.07 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  26.92 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  27.61 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  26.17 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  28.11 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  35.86 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  29.05 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  35.17 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  29.93 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  26.16 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  27.69 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  25.09 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  27.33 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  26.19 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  25.85 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  25.85 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  25.16 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  22.64 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  34.48 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2573  auxin efflux carrier  23.73 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  25.85 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  34.48 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  26.78 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  29.61 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003704  membrane protein  25.26 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  25.99 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  34.24 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  24.46 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  27.74 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  29.83 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0363  auxin efflux carrier  28.86 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.422353  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  28.36 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  34.93 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1325  auxin efflux carrier  26.19 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.641195  normal  0.474825 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  26.41 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  29 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  28.15 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  28.04 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  27.6 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  26.79 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  23.58 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  30.2 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  27.27 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  27.17 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  27.36 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  24.91 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  28.72 
 
 		 318 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  28.03 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0121  auxin efflux carrier  28.86 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  25.83 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  32.17 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  27.71 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  26.64 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  28.87 
 
 		 318 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  28.87 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2151  Auxin Efflux Carrier  25.64 
 
 		 302 aa  65.5  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  24.45 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>