108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3581 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  100 
 
 		 308 aa  604  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1289  Auxin Efflux Carrier  44.41 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00114363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  31.58 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4274  auxin efflux carrier  28.57 
 
 		 329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13529  normal  0.159694 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  30.56 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  26.33 
 
 		 301 aa  89.4  8e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  28.52 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  27.74 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  30.7 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  29.77 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  26.89 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05181  AEC family transporter  26.28 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  28.66 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  26.84 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  23.18 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  27.36 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  25.17 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  28.31 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  25.23 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.1 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  25 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12031  permease  26.11 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.194304 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  27.65 
 
 		 305 aa  67  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  25 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  27.24 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  26.85 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  30.1 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  25 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0265  hypothetical protein  27.52 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  28.64 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  25.81 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0577  auxin efflux carrier  26.14 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  28.05 
 
 		 309 aa  62.4  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0478  permease  25.16 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.357892  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  21.73 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  23 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  23.44 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  26.05 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  24.05 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  25.55 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  24.61 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  22.51 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  27.36 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  27.45 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0852  AEC family transporter  27.04 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.670822  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1803  AEC family transporter  27.04 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.362237 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  30.24 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  24.68 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  27.36 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0983  conserved hypothetical integral membrane protein, predicted permease  27.52 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.531799  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  24.53 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1093  hypothetical protein  26.61 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.795782  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11981  hypothetical protein  24.18 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.944523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  22.04 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  23.12 
 
 		 301 aa  55.8  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  23.81 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  24.02 
 
 		 306 aa  54.3  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1460  putative auxin efflux carrier  22.57 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0835  putative auxin efflux carrier  22.57 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0718  Auxin Efflux Carrier  23.13 
 
 		 318 aa  52.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  23.29 
 
 		 301 aa  52.8  0.000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2190  auxin efflux carrier  26.34 
 
 		 306 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1848  auxin efflux carrier, putative  22.57 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  26.64 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2151  putative auxin efflux carrier  22.57 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0521  auxin efflux carrier family protein  22.57 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0424  auxin efflux carrier family protein  22.57 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  25.37 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  23.64 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2100  auxin efflux carrier, putative  22.92 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939819  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4929  Auxin Efflux Carrier  24.91 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  24.77 
 
 		 325 aa  49.3  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  23.3 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  27.05 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  26.57 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  26.89 
 
 		 330 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  24 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  25.49 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  27.63 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  22.12 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0404  Auxin Efflux Carrier  25.4 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.989352  normal  0.549528 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  29.93 
 
 		 342 aa  47  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  29.93 
 
 		 342 aa  47  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  23.05 
 
 		 324 aa  46.6  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1276  ABC transporter  25 
 
 		 261 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  25.62 
 
 		 309 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1602  auxin efflux carrier  25.37 
 
 		 293 aa  45.8  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  31.69 
 
 		 313 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  29.93 
 
 		 367 aa  45.8  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  23.79 
 
 		 297 aa  45.4  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  28.29 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  25.41 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  23.45 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  25 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3151  auxin efflux carrier  24.44 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  23.15 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  26.97 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  24.77 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>