124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2895 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 302 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  84.77 
 
 		 302 aa  479  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0265  hypothetical protein  61.28 
 
 		 300 aa  345  8e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  57.24 
 
 		 298 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  41.67 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0577  auxin efflux carrier  46.74 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  37.09 
 
 		 305 aa  187  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  37.75 
 
 		 301 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  37.97 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  36.91 
 
 		 301 aa  168  8e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  35.71 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  35.91 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  34.68 
 
 		 302 aa  159  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  31.41 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  34.88 
 
 		 300 aa  136  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2190  auxin efflux carrier  37.37 
 
 		 306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  26.85 
 
 		 302 aa  123  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  29.06 
 
 		 301 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  29.29 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  29.29 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  26.76 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2100  auxin efflux carrier, putative  29.9 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939819  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0521  auxin efflux carrier family protein  29.9 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1460  putative auxin efflux carrier  29.57 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0835  putative auxin efflux carrier  29.57 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1848  auxin efflux carrier, putative  29.57 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2151  putative auxin efflux carrier  29.57 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0424  auxin efflux carrier family protein  29.57 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  26.52 
 
 		 302 aa  92.8  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  25.62 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0983  conserved hypothetical integral membrane protein, predicted permease  27.99 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.531799  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  28.09 
 
 		 315 aa  82.4  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  25.89 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  26.37 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  25.24 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  25.41 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  21.84 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  28.37 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  25.24 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  31.86 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  28.88 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1289  Auxin Efflux Carrier  27.02 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00114363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  25.86 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  27.46 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  28.24 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  26.09 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  27.14 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1093  hypothetical protein  31.73 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.795782  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  29.03 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  27.7 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  26.09 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  26.21 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  27.89 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  23.59 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  25.39 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  25.47 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  25.78 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  22.26 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  24.3 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  26.67 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  22.26 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  24.76 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  26.15 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  23.97 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  24.76 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  22.82 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  24.45 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  26.14 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  26.13 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  23.01 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  27.24 
 
 		 322 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  23.1 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  26.86 
 
 		 307 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  24.01 
 
 		 325 aa  53.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  27.8 
 
 		 297 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  25.82 
 
 		 305 aa  53.1  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  25.87 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  24.91 
 
 		 306 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  27.32 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1198  auxin efflux carrier  25.17 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000200283  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  26.54 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  23.27 
 
 		 319 aa  50.4  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  24.68 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  24.44 
 
 		 321 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  27.27 
 
 		 297 aa  50.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0509  auxin efflux carrier family protein  27.71 
 
 		 349 aa  49.7  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0577752  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  25.59 
 
 		 317 aa  49.3  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  27.84 
 
 		 310 aa  49.3  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0498  auxin efflux carrier family protein  27.11 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  28.2 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  26.07 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  25.37 
 
 		 324 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  26.22 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  26.87 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  23.89 
 
 		 325 aa  47  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  27.18 
 
 		 307 aa  47  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  28.74 
 
 		 308 aa  46.6  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  26.97 
 
 		 319 aa  46.2  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  30.61 
 
 		 306 aa  46.6  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  27.38 
 
 		 313 aa  46.2  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>