59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1848 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1848  auxin efflux carrier, putative  100 
 
 		 337 aa  651    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0424  auxin efflux carrier family protein  100 
 
 		 337 aa  651    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2151  putative auxin efflux carrier  100 
 
 		 337 aa  651    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1460  putative auxin efflux carrier  100 
 
 		 299 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0835  putative auxin efflux carrier  100 
 
 		 299 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0521  auxin efflux carrier family protein  99 
 
 		 299 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2100  auxin efflux carrier, putative  93.98 
 
 		 299 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939819  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  37.76 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  37.16 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  36.58 
 
 		 301 aa  176  5e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  35.79 
 
 		 301 aa  175  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  35.91 
 
 		 298 aa  169  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  35.91 
 
 		 302 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  34.35 
 
 		 300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  26.6 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2190  auxin efflux carrier  35.56 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  32.19 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  28 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0577  auxin efflux carrier  33.9 
 
 		 303 aa  112  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  30.23 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0265  hypothetical protein  29.45 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  29.57 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  23.15 
 
 		 302 aa  92.4  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  27.02 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  25.45 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  24.38 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.14 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  23.66 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  21.03 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1198  auxin efflux carrier  21.92 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000200283  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  24.62 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  25.59 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  28.47 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  24.51 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  25.68 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  27.68 
 
 		 321 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  23.74 
 
 		 304 aa  53.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  23.13 
 
 		 308 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  25.63 
 
 		 318 aa  51.2  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  20.16 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  23.38 
 
 		 308 aa  51.2  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  29.08 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0806  auxin efflux carrier  24.82 
 
 		 297 aa  50.1  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00330706  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  30.12 
 
 		 330 aa  49.7  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  24.19 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  19.76 
 
 		 303 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  23.61 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  22.75 
 
 		 314 aa  48.5  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  29.49 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  23.21 
 
 		 306 aa  46.6  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  27.11 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  21.45 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  22.41 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  25.76 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  21.77 
 
 		 312 aa  43.9  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  21.24 
 
 		 321 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  25.86 
 
 		 307 aa  42.7  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  25.63 
 
 		 314 aa  42.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  24.24 
 
 		 309 aa  42.4  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>