165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6049 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  100 
 
 		 302 aa  584  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  49.66 
 
 		 301 aa  281  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  49.49 
 
 		 301 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  48.99 
 
 		 301 aa  268  8.999999999999999e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  47.3 
 
 		 301 aa  259  3e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  50.17 
 
 		 298 aa  257  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  39.26 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  36.27 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2100  auxin efflux carrier, putative  36.91 
 
 		 299 aa  178  9e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939819  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1460  putative auxin efflux carrier  35.91 
 
 		 299 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0835  putative auxin efflux carrier  35.91 
 
 		 299 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1848  auxin efflux carrier, putative  35.91 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  35.05 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2151  putative auxin efflux carrier  35.91 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0521  auxin efflux carrier family protein  35.91 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0424  auxin efflux carrier family protein  35.91 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  35.76 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  34.68 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2190  auxin efflux carrier  37.54 
 
 		 306 aa  159  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  34.78 
 
 		 302 aa  159  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0265  hypothetical protein  33.67 
 
 		 300 aa  145  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0577  auxin efflux carrier  35.4 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  31.65 
 
 		 298 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  29.53 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  31.54 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  31.02 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  29.79 
 
 		 302 aa  112  7.000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  27.15 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  26.07 
 
 		 304 aa  96.7  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  25.83 
 
 		 307 aa  95.5  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.65 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  29.02 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  25.25 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  27.49 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  27.49 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  26.62 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0983  conserved hypothetical integral membrane protein, predicted permease  28.79 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.531799  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  29.37 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  24.17 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  30.72 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  25.41 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3336  auxin efflux carrier  26.16 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  22.68 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  28.57 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  25.08 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1093  hypothetical protein  31.1 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.795782  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  24.51 
 
 		 317 aa  67  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  25.31 
 
 		 328 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  29.78 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  26.47 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  25.97 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  26.09 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  26.4 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  26.18 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  20.75 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  24.28 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  23.95 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0806  auxin efflux carrier  26.64 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00330706  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  24.59 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  28.67 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  26.73 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  26.58 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  24.03 
 
 		 315 aa  58.9  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  26.89 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  24 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  26.25 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  26.48 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  24.36 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  25.66 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  24.83 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  22.98 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  26.13 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  21.43 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  23.78 
 
 		 322 aa  54.3  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  27 
 
 		 318 aa  54.3  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  24.73 
 
 		 315 aa  53.1  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  24.28 
 
 		 318 aa  53.1  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.14 
 
 		 318 aa  53.1  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  27.8 
 
 		 313 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  26.18 
 
 		 317 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  34.48 
 
 		 304 aa  52.8  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  24.08 
 
 		 320 aa  52.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  26.69 
 
 		 291 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  26.45 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  23.99 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  28.25 
 
 		 306 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3917  auxin efflux carrier  29.89 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  22.98 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  29.44 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  22.65 
 
 		 305 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  26.33 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  24.17 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  23.29 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  27.5 
 
 		 317 aa  50.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  24.41 
 
 		 320 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  25.49 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  26 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  25.6 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>