121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0214 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  592  1e-168  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4274  auxin efflux carrier  45.3 
 
 		 329 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13529  normal  0.159694 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  30.42 
 
 		 308 aa  148  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1289  Auxin Efflux Carrier  33.45 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00114363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1093  hypothetical protein  34.06 
 
 		 313 aa  77  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.795782  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  30.84 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  27.65 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  29.19 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  32.9 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  29.95 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  30.2 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  23.42 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  26.32 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  28.66 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  28.66 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  24.42 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  31.67 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  31.67 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  27.48 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  31.22 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  28.67 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1602  auxin efflux carrier  21.83 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  30.77 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  28.08 
 
 		 302 aa  53.1  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  28.4 
 
 		 324 aa  52.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  28.67 
 
 		 315 aa  52.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  27.6 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  22.78 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  29.58 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2172  hypothetical protein  30.28 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  30.14 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  23.61 
 
 		 309 aa  51.6  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  25.32 
 
 		 314 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  26.54 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  22.78 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  29.58 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  23.19 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  29.95 
 
 		 316 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  28.9 
 
 		 318 aa  50.1  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  30.45 
 
 		 312 aa  50.1  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2443  Auxin Efflux Carrier  29.91 
 
 		 305 aa  50.1  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  28.17 
 
 		 305 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  29.58 
 
 		 305 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  36.96 
 
 		 299 aa  49.7  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  35.17 
 
 		 302 aa  49.7  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  25.88 
 
 		 305 aa  49.7  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  21.43 
 
 		 306 aa  49.7  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  28.87 
 
 		 305 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  29.58 
 
 		 305 aa  49.3  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  29.58 
 
 		 305 aa  49.3  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  29.58 
 
 		 305 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  27.71 
 
 		 305 aa  49.3  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02282  predicted transporter  26.71 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2509  putative transporter YfdV  26.71 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.122299  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02243  hypothetical protein  26.71 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  22.27 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  23.45 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  28.3 
 
 		 312 aa  47.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  32.2 
 
 		 342 aa  47.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  33.61 
 
 		 342 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  21.9 
 
 		 320 aa  47  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  29.38 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  31.82 
 
 		 317 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  21.8 
 
 		 303 aa  47  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  26.38 
 
 		 330 aa  46.2  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  35.17 
 
 		 319 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  26.03 
 
 		 301 aa  45.8  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  27.15 
 
 		 304 aa  45.8  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  27.41 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  28.81 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  20.94 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  23.1 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0577  auxin efflux carrier  28.06 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05181  AEC family transporter  23.7 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  27.97 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  27.42 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  27.42 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  29.76 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  27.42 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  27.42 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  28.12 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  28.57 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  21.59 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  24.2 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  23.13 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  28.12 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  35.17 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  31.15 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  27.78 
 
 		 314 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  33.99 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  23.33 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  26.61 
 
 		 320 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  25.91 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  24.2 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  29.66 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  25.32 
 
 		 295 aa  43.9  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0538  Auxin Efflux Carrier  23.42 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.163625  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  21.23 
 
 		 361 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  36.23 
 
 		 325 aa  43.5  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  27.86 
 
 		 320 aa  43.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>