111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0756 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  100 
 
 		 301 aa  580  1e-164  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  61.54 
 
 		 302 aa  375  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  59.53 
 
 		 301 aa  362  4e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  54.76 
 
 		 303 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  54.76 
 
 		 303 aa  312  4.999999999999999e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  53.4 
 
 		 306 aa  305  5.0000000000000004e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0983  conserved hypothetical integral membrane protein, predicted permease  52.38 
 
 		 303 aa  266  2e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.531799  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  33.45 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  35.25 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  30.2 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  26.96 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  28.72 
 
 		 301 aa  103  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0265  hypothetical protein  29.93 
 
 		 300 aa  102  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  28.95 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  31.01 
 
 		 302 aa  99.8  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  26.99 
 
 		 305 aa  96.3  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  27.69 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  28.26 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  29.75 
 
 		 301 aa  93.2  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  27.67 
 
 		 298 aa  86.3  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  25.87 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3336  auxin efflux carrier  25.5 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0577  auxin efflux carrier  24.57 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  29.15 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  28.14 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  30.67 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  24.68 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1460  putative auxin efflux carrier  24.3 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2100  auxin efflux carrier, putative  24.3 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939819  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0835  putative auxin efflux carrier  24.3 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1848  auxin efflux carrier, putative  24.3 
 
 		 337 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2151  putative auxin efflux carrier  24.3 
 
 		 337 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0424  auxin efflux carrier family protein  24.3 
 
 		 337 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  24.59 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0521  auxin efflux carrier family protein  23.94 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  24.19 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  26.82 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  27.11 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  24.31 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  30.1 
 
 		 308 aa  65.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  26.49 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  24.01 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  22.8 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  27.92 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  26.49 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  24.9 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  26.37 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2190  auxin efflux carrier  24.53 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  23.2 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  25.87 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  24.33 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  23.58 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  24.39 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  24.16 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  29.13 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  26.47 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  27.05 
 
 		 314 aa  52.8  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  21.57 
 
 		 318 aa  52.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  21.57 
 
 		 318 aa  52.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  22.74 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  24.35 
 
 		 301 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  25 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  23.31 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  22.46 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  26.89 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  21.24 
 
 		 318 aa  50.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1289  Auxin Efflux Carrier  28.5 
 
 		 324 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00114363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  24.76 
 
 		 312 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  26.03 
 
 		 309 aa  49.3  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  25.48 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  22.68 
 
 		 322 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  25.5 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  29.91 
 
 		 325 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  21.85 
 
 		 318 aa  47  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  28.69 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0540  auxin efflux carrier  22.37 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  25.35 
 
 		 312 aa  46.6  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  26.55 
 
 		 302 aa  46.6  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  24.89 
 
 		 307 aa  46.2  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  25.46 
 
 		 317 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  24.42 
 
 		 292 aa  46.2  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  21.85 
 
 		 318 aa  46.2  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  23.49 
 
 		 311 aa  45.8  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  22.05 
 
 		 319 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  25.09 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  25.16 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  22.58 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  25.08 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  23.16 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1093  hypothetical protein  25.28 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.795782  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  27.04 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  25.48 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  23.7 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  28.89 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  23.16 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  25.48 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  26.32 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0509  auxin efflux carrier family protein  25.95 
 
 		 349 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0577752  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  22.9 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  26.52 
 
 		 342 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>