150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0983 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0983  conserved hypothetical integral membrane protein, predicted permease  100 
 
 		 303 aa  584  1e-166  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.531799  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  63 
 
 		 303 aa  384  1e-105  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  62.67 
 
 		 303 aa  384  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  52.49 
 
 		 306 aa  328  7e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  52.28 
 
 		 301 aa  288  1e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  47.83 
 
 		 301 aa  280  2e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  48.15 
 
 		 302 aa  277  1e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  34.78 
 
 		 302 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  28.82 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  27.93 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  27.61 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  28.8 
 
 		 306 aa  92.4  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  26.35 
 
 		 301 aa  90.1  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  27.3 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0577  auxin efflux carrier  28.42 
 
 		 303 aa  86.3  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  30.36 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  26.28 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  26.94 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0265  hypothetical protein  27.99 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  28.97 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  28.62 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  22.04 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  27.89 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  26.64 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  23.59 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  25.96 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  27.16 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  25.41 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  27 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  28.31 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  24.6 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  27.12 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  28.85 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  28 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  25.34 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  24.68 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  24.64 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3336  auxin efflux carrier  24.78 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  23.42 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  26.88 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0034  auxin efflux carrier  26.92 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  26.49 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  22.81 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  23.29 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  25 
 
 		 297 aa  57  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  26.91 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  26.97 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  26.97 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  22.36 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2190  auxin efflux carrier  22.22 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  27.8 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.97 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  23.36 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  25.4 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  23.93 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  23.08 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  23.01 
 
 		 316 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  27.82 
 
 		 296 aa  53.9  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  27.86 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  25.89 
 
 		 306 aa  53.1  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  26.15 
 
 		 332 aa  52.8  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2172  hypothetical protein  26.43 
 
 		 305 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  27.57 
 
 		 313 aa  52.8  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  22.35 
 
 		 322 aa  51.6  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  25.5 
 
 		 318 aa  51.6  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  27.76 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  23.55 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  23.29 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  28.63 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  21.63 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  21.63 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  24.69 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  27.42 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02282  predicted transporter  26.18 
 
 		 314 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02243  hypothetical protein  26.18 
 
 		 314 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  28.24 
 
 		 322 aa  50.4  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  24.42 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  21.84 
 
 		 320 aa  50.4  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  23.66 
 
 		 320 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2509  putative transporter YfdV  26.18 
 
 		 314 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.122299  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  21.73 
 
 		 322 aa  50.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  21.84 
 
 		 319 aa  49.7  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0231  Auxin Efflux Carrier  25.27 
 
 		 353 aa  49.7  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  23.62 
 
 		 320 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  25.71 
 
 		 305 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  23.42 
 
 		 305 aa  49.7  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  21.86 
 
 		 329 aa  49.3  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  23.04 
 
 		 307 aa  49.3  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  22.87 
 
 		 313 aa  49.3  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  28.24 
 
 		 312 aa  48.9  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  28.24 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  23.27 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  21.84 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  22.19 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  23.03 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  25 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  25 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  25 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  22.77 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  22.54 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>