82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0265 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0265  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  61 
 
 
302 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  61.28 
 
 
302 aa  336  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  52.19 
 
 
298 aa  290  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0577  auxin efflux carrier  46.74 
 
 
303 aa  196  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  36.9 
 
 
299 aa  196  3e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  38.74 
 
 
301 aa  177  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  37.75 
 
 
298 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  34.56 
 
 
305 aa  162  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  36.61 
 
 
301 aa  152  5e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  34.12 
 
 
301 aa  151  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  33.67 
 
 
301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  33.67 
 
 
302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  28.57 
 
 
303 aa  125  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  26.07 
 
 
302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  32.74 
 
 
300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2100  auxin efflux carrier, putative  30.82 
 
 
299 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939819  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0521  auxin efflux carrier family protein  29.79 
 
 
299 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  28.07 
 
 
303 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  28.42 
 
 
303 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  30.22 
 
 
301 aa  100  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1460  putative auxin efflux carrier  29.45 
 
 
299 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0835  putative auxin efflux carrier  29.45 
 
 
299 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  27.94 
 
 
302 aa  99  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0424  auxin efflux carrier family protein  29.45 
 
 
337 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2151  putative auxin efflux carrier  29.45 
 
 
337 aa  98.6  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1848  auxin efflux carrier, putative  29.45 
 
 
337 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.99 
 
 
301 aa  97.4  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  27.91 
 
 
302 aa  94.4  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2190  auxin efflux carrier  32.12 
 
 
306 aa  89  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  27.16 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  27.24 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  26.85 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0983  conserved hypothetical integral membrane protein, predicted permease  28.62 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.531799  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  26.17 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  25.49 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.2 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  27.45 
 
 
308 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  30.41 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  24.34 
 
 
315 aa  59.7  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  27.78 
 
 
310 aa  56.6  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  26.85 
 
 
301 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1289  Auxin Efflux Carrier  26.37 
 
 
324 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00114363  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  23.25 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0560  permeases-like  25.74 
 
 
297 aa  53.9  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00020008  normal  0.118389 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  26.44 
 
 
297 aa  54.3  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  24.16 
 
 
315 aa  53.1  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  25.28 
 
 
296 aa  53.5  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  24.38 
 
 
313 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  24.38 
 
 
315 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  24.73 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1093  hypothetical protein  28.95 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.795782  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0853  Auxin Efflux Carrier  25.09 
 
 
297 aa  50.4  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  24.91 
 
 
296 aa  50.8  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  23.72 
 
 
317 aa  49.3  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  23.59 
 
 
318 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  23.24 
 
 
318 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1198  auxin efflux carrier  22.61 
 
 
306 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000200283  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  23.59 
 
 
318 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  29 
 
 
315 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  20.92 
 
 
316 aa  47.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  23.32 
 
 
313 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0806  auxin efflux carrier  23.41 
 
 
297 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00330706  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  23.18 
 
 
316 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  23.83 
 
 
306 aa  46.6  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  24.51 
 
 
307 aa  46.6  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  21.31 
 
 
325 aa  46.6  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  25.78 
 
 
304 aa  45.8  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  22.98 
 
 
318 aa  45.8  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  23.24 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0024  Auxin Efflux Carrier  28.32 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  27.38 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  28.12 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  23.93 
 
 
321 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  30.48 
 
 
337 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  27.6 
 
 
305 aa  43.5  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  23.24 
 
 
318 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  25.69 
 
 
327 aa  43.5  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  27.68 
 
 
332 aa  43.1  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3176  auxin efflux carrier  27.63 
 
 
310 aa  42.7  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  25.69 
 
 
312 aa  42.4  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  23.95 
 
 
302 aa  42.4  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>