102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2190 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2190  auxin efflux carrier  100 
 
 		 306 aa  570  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  64.9 
 
 		 300 aa  351  8e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  39 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  37.67 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  38.76 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  37.95 
 
 		 301 aa  178  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  39 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  36.42 
 
 		 302 aa  166  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  35.08 
 
 		 305 aa  136  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1460  putative auxin efflux carrier  36.09 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2100  auxin efflux carrier, putative  35.43 
 
 		 299 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939819  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0835  putative auxin efflux carrier  36.09 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0521  auxin efflux carrier family protein  36.09 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1848  auxin efflux carrier, putative  36.09 
 
 		 337 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2151  putative auxin efflux carrier  36.09 
 
 		 337 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0424  auxin efflux carrier family protein  36.09 
 
 		 337 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  33.22 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  37.19 
 
 		 302 aa  125  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  35.44 
 
 		 302 aa  125  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  24.51 
 
 		 302 aa  99.4  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.08 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  28.19 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0265  hypothetical protein  31.05 
 
 		 300 aa  95.9  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0577  auxin efflux carrier  30.58 
 
 		 303 aa  89  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  28.47 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  24.22 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  22.45 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  24.52 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  22.18 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  31.01 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0983  conserved hypothetical integral membrane protein, predicted permease  21.93 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.531799  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  21.61 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  21.77 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  23.19 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  23.16 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  24.07 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  24.51 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  24.2 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  28.21 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  23.55 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  25.19 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  24.32 
 
 		 315 aa  54.7  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  26.24 
 
 		 304 aa  55.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  29.38 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  25.68 
 
 		 328 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  27.89 
 
 		 336 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  27.89 
 
 		 310 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  31.37 
 
 		 313 aa  52.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  25.16 
 
 		 322 aa  52.4  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  27.89 
 
 		 339 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  29.92 
 
 		 317 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  28.42 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  28.42 
 
 		 336 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  21.32 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  29.44 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  22.92 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  22.87 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  26.3 
 
 		 315 aa  50.1  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  28.57 
 
 		 322 aa  50.1  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  29.28 
 
 		 325 aa  50.1  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  31.53 
 
 		 337 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  28.74 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  24.43 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  26.04 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  23.08 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  29.41 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  27.76 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  29.95 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  25.11 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  28.17 
 
 		 319 aa  46.6  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  27.89 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  27.21 
 
 		 313 aa  46.2  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  27.54 
 
 		 321 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  27.98 
 
 		 320 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  24.41 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  28.88 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  27.12 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  25.52 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  31.06 
 
 		 316 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  28.16 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0034  Auxin Efflux Carrier  29.46 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1093  hypothetical protein  29.78 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.795782  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  27.87 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  25.94 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  25.94 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  21.98 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  27.1 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  29.01 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  26.86 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  26.97 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  26.56 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  31.09 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  25.81 
 
 		 317 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  29.67 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  26.86 
 
 		 318 aa  43.1  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2022  Auxin Efflux Carrier  24.55 
 
 		 297 aa  43.1  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  23.51 
 
 		 314 aa  42.7  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  24.28 
 
 		 317 aa  42.7  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  25.1 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>