41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2022 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2022  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 
297 aa  578  1e-164  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0024  Auxin Efflux Carrier  24.1 
 
 
299 aa  97.8  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0806  auxin efflux carrier  22.3 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00330706  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0853  Auxin Efflux Carrier  25.7 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22310  Auxin Efflux Carrier  26.64 
 
 
318 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1198  auxin efflux carrier  29.82 
 
 
306 aa  67  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000200283  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0560  permeases-like  23.6 
 
 
297 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00020008  normal  0.118389 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1750  Auxin Efflux Carrier  25.7 
 
 
296 aa  59.3  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  25.25 
 
 
313 aa  58.9  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1605  auxin efflux carrier  25.16 
 
 
322 aa  58.5  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  21.74 
 
 
305 aa  57  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_95034  predicted protein  26.06 
 
 
505 aa  56.6  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.234943  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0695  auxin efflux carrier  24 
 
 
285 aa  56.6  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.229992  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  30.59 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0719  auxin efflux carrier  23.27 
 
 
285 aa  53.9  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.224926  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  30.59 
 
 
304 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  21.67 
 
 
307 aa  53.5  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  30.46 
 
 
301 aa  53.5  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1840  hypothetical protein  22.39 
 
 
302 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.126779  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  25.59 
 
 
309 aa  51.6  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  24.74 
 
 
324 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  26.02 
 
 
307 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  23.76 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  23.99 
 
 
299 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  23.93 
 
 
303 aa  47  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  25.25 
 
 
306 aa  46.6  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  22.82 
 
 
306 aa  46.2  0.0006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  24.16 
 
 
310 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  25 
 
 
302 aa  46.2  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0540  auxin efflux carrier  27.15 
 
 
292 aa  45.8  0.0009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  24.14 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  21.05 
 
 
306 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  24.32 
 
 
306 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  26.1 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  23.38 
 
 
299 aa  43.5  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0291  Auxin Efflux Carrier  24.03 
 
 
317 aa  43.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  21.65 
 
 
315 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  22.22 
 
 
302 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2284  hypothetical protein  21 
 
 
302 aa  42.7  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2325  hypothetical protein  21 
 
 
302 aa  42.7  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  21.28 
 
 
309 aa  42.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>