87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0806 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0806  auxin efflux carrier  100 
 
 		 297 aa  573  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00330706  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0853  Auxin Efflux Carrier  54.21 
 
 		 297 aa  271  1e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0560  permeases-like  50.9 
 
 		 297 aa  247  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00020008  normal  0.118389 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0520  Auxin Efflux Carrier  44.22 
 
 		 299 aa  185  7e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000302523  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0024  Auxin Efflux Carrier  34.28 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2022  Auxin Efflux Carrier  22.3 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  25.85 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1198  auxin efflux carrier  25.17 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000200283  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  27.36 
 
 		 295 aa  67  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  25.6 
 
 		 307 aa  67  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  26.37 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  25.68 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  27 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  26.01 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  27.05 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  27.3 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  23.61 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  26.19 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  26.71 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  25.35 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1750  Auxin Efflux Carrier  22.7 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  27.24 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  22.48 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  27.31 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  27.88 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  25.59 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  23.15 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  27 
 
 		 309 aa  53.9  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  22.98 
 
 		 304 aa  53.1  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  22.9 
 
 		 313 aa  52.8  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  23.64 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  25 
 
 		 318 aa  50.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  23.78 
 
 		 308 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  23.93 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  25 
 
 		 318 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  27.8 
 
 		 302 aa  49.7  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  25.96 
 
 		 308 aa  50.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  21.41 
 
 		 305 aa  49.7  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  25.76 
 
 		 318 aa  49.3  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 301 aa  49.3  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  24.66 
 
 		 318 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  23.37 
 
 		 315 aa  49.3  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  24.66 
 
 		 318 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  22.84 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  24.35 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  22.48 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  25.69 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  24.34 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  24.12 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  24.74 
 
 		 305 aa  47.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  24.88 
 
 		 303 aa  47  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  23.23 
 
 		 315 aa  45.8  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1605  auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.62 
 
 		 295 aa  45.8  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1522  auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.62 
 
 		 295 aa  45.8  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.919635  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  28.34 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  23.87 
 
 		 306 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  23.36 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  24.37 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  20 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  20 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  23.1 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  23.62 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0100  hypothetical protein  27.14 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  20 
 
 		 318 aa  43.9  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  22.86 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  24.42 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5541  Auxin Efflux Carrier  23.63 
 
 		 307 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.642823  normal  0.193428 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  25.68 
 
 		 302 aa  43.5  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  23.72 
 
 		 361 aa  43.9  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  21.68 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  20.94 
 
 		 330 aa  43.5  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  24.28 
 
 		 301 aa  43.1  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  27.6 
 
 		 294 aa  43.5  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  24.41 
 
 		 302 aa  43.5  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  27.54 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  23.39 
 
 		 318 aa  43.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  22.65 
 
 		 318 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  26.18 
 
 		 304 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  22.73 
 
 		 318 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 296 aa  43.1  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  23.38 
 
 		 318 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2426  Auxin Efflux Carrier  26.8 
 
 		 303 aa  42.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  26.3 
 
 		 305 aa  42.7  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 296 aa  42.4  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  23.87 
 
 		 309 aa  42.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0265  hypothetical protein  22.07 
 
 		 300 aa  42.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  23.98 
 
 		 299 aa  42.4  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>