93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0100 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0100  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1522  auxin efflux carrier (AEC) family protein  99.32 
 
 
295 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.919635  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1605  auxin efflux carrier (AEC) family protein  99.32 
 
 
295 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  39.84 
 
 
294 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23880  membrane protein  37.89 
 
 
296 aa  147  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  37.63 
 
 
291 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  36.49 
 
 
291 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  36.93 
 
 
291 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42100  hypothetical protein  36.97 
 
 
295 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  35.69 
 
 
294 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  37.28 
 
 
291 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  31.67 
 
 
291 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3571  hypothetical protein  37.54 
 
 
295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  30.6 
 
 
293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  31.58 
 
 
295 aa  125  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  29.74 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  28.11 
 
 
291 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003704  membrane protein  31.14 
 
 
293 aa  92.4  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  29.56 
 
 
293 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  26.48 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  26.79 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  31.68 
 
 
292 aa  82.4  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2573  auxin efflux carrier  29.44 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4185  auxin efflux carrier  22.86 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  26.32 
 
 
326 aa  79  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  28.04 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0851  hypothetical protein  30.14 
 
 
291 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.180241  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  24.64 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  29.27 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  28.32 
 
 
301 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  29.15 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  30.04 
 
 
302 aa  67  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  26.44 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  24.54 
 
 
310 aa  65.1  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  32.08 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  28.72 
 
 
297 aa  63.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  25.83 
 
 
297 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  25.51 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  21.72 
 
 
306 aa  60.8  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  25.83 
 
 
297 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  28.68 
 
 
305 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  23.56 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  24.01 
 
 
306 aa  56.6  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  29.07 
 
 
310 aa  56.6  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  26.54 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0034  Auxin Efflux Carrier  23.74 
 
 
307 aa  53.1  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  20.13 
 
 
320 aa  53.1  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  25.12 
 
 
306 aa  52.8  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  28.02 
 
 
305 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  24.41 
 
 
299 aa  52.4  0.000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  28.06 
 
 
322 aa  52.4  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  25.41 
 
 
311 aa  52.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  32.12 
 
 
319 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  29 
 
 
305 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  25.9 
 
 
306 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  28.93 
 
 
305 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  28.72 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  26.53 
 
 
305 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  26.53 
 
 
305 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  27.94 
 
 
305 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  25.71 
 
 
321 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  23.25 
 
 
318 aa  49.7  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  23.25 
 
 
318 aa  49.7  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  27.94 
 
 
305 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2172  hypothetical protein  29.44 
 
 
305 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  29.18 
 
 
301 aa  49.7  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1504  auxin efflux carrier  28.8 
 
 
315 aa  49.7  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0538  Auxin Efflux Carrier  25.62 
 
 
309 aa  49.3  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.163625  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  23.25 
 
 
318 aa  49.3  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  28.43 
 
 
305 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1602  auxin efflux carrier  26.18 
 
 
293 aa  47.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  22.38 
 
 
308 aa  46.6  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  26.67 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  25.69 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  25.23 
 
 
315 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0363  auxin efflux carrier  31.53 
 
 
307 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.422353  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  24.2 
 
 
328 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  27.45 
 
 
318 aa  43.9  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  21.67 
 
 
297 aa  43.5  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  22.18 
 
 
312 aa  43.5  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  28.34 
 
 
290 aa  43.5  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  27.88 
 
 
311 aa  43.5  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  25.35 
 
 
309 aa  43.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  24.38 
 
 
315 aa  43.5  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  26.19 
 
 
303 aa  43.1  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2443  Auxin Efflux Carrier  27.33 
 
 
305 aa  43.1  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3176  auxin efflux carrier  26.92 
 
 
310 aa  43.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  27.09 
 
 
309 aa  43.1  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  24.39 
 
 
315 aa  42.7  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  26.13 
 
 
302 aa  42.7  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  25.08 
 
 
309 aa  42.7  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  20.93 
 
 
313 aa  42.4  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  23.32 
 
 
314 aa  42.4  0.009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>