115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0851 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0851  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.180241  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  71.13 
 
 		 292 aa  417  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003704  membrane protein  71.82 
 
 		 293 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  38.7 
 
 		 291 aa  195  9e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  38.16 
 
 		 295 aa  177  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4185  auxin efflux carrier  36.9 
 
 		 295 aa  177  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  38.14 
 
 		 295 aa  175  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  36.52 
 
 		 291 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  34.13 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2573  auxin efflux carrier  33.45 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  34.11 
 
 		 304 aa  155  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  30.69 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  29.66 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  30.8 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  31.56 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  30.93 
 
 		 291 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23880  membrane protein  31.85 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  30.2 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  31.16 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  30.74 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42100  hypothetical protein  29.35 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  29.57 
 
 		 293 aa  85.9  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  29.25 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1605  auxin efflux carrier (AEC) family protein  29.37 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1522  auxin efflux carrier (AEC) family protein  29.37 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.919635  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3571  hypothetical protein  30.14 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0100  hypothetical protein  29.02 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  24 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  27.17 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  25.26 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  30.1 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  27.39 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3176  auxin efflux carrier  27.3 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  32.64 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  30.9 
 
 		 294 aa  67  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  29.33 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  23.1 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  28.11 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  27.16 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  22.76 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  24.52 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  29.7 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  24.52 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  27.93 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2903  auxin efflux carrier  27.59 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.788833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0538  Auxin Efflux Carrier  22.82 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.163625  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  25.69 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  21.89 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  22.71 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  26.58 
 
 		 317 aa  53.5  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  27.68 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  30 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  32.14 
 
 		 319 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  24.88 
 
 		 319 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  26.94 
 
 		 306 aa  52.8  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  25.13 
 
 		 307 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  24.58 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  24.5 
 
 		 312 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  24.09 
 
 		 311 aa  50.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  26.38 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1325  auxin efflux carrier  25.95 
 
 		 302 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.641195  normal  0.474825 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  27.45 
 
 		 306 aa  49.3  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  26.9 
 
 		 306 aa  49.3  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  25.48 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  25.28 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  25.13 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  25.13 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  25.51 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  28.65 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  23.65 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  25.91 
 
 		 309 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  23.64 
 
 		 308 aa  46.6  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  22.01 
 
 		 313 aa  46.6  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  26.11 
 
 		 330 aa  46.6  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  27.99 
 
 		 299 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  25.63 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  24.73 
 
 		 314 aa  46.6  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  25.13 
 
 		 305 aa  46.2  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  25.13 
 
 		 305 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  25 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  26.84 
 
 		 315 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  24.68 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  23.41 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  18.81 
 
 		 306 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  29.66 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  25.8 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  24.66 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  25.89 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  26.82 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  21.43 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  25.9 
 
 		 362 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  25.13 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  30.46 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  22.12 
 
 		 320 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  26.49 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2022  Auxin Efflux Carrier  24.14 
 
 		 297 aa  43.5  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  25.58 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  24.62 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>