255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3677 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 
308 aa  599  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  82.41 
 
 
307 aa  458  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  51.84 
 
 
326 aa  286  4e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  43.32 
 
 
306 aa  247  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12560  predicted permease  43.54 
 
 
308 aa  237  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270309  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  43.31 
 
 
290 aa  232  6e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3295  Auxin Efflux Carrier  42.21 
 
 
309 aa  227  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  40.32 
 
 
307 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  40.91 
 
 
307 aa  217  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  42.3 
 
 
309 aa  215  8e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  41.48 
 
 
309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1014  Auxin Efflux Carrier  41.84 
 
 
306 aa  209  5e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152875  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  40.97 
 
 
308 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  40.91 
 
 
307 aa  202  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  35.88 
 
 
314 aa  201  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  36.93 
 
 
305 aa  200  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2397  Auxin Efflux Carrier  41.61 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  34.55 
 
 
313 aa  192  6e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17720  predicted permease  40.78 
 
 
310 aa  175  8e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302004  normal  0.264238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  30.06 
 
 
347 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0034  auxin efflux carrier  34.62 
 
 
279 aa  152  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2219  Auxin Efflux Carrier  34.91 
 
 
312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  28.57 
 
 
314 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  27.67 
 
 
314 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  28.91 
 
 
313 aa  100  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  28.81 
 
 
319 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  26.5 
 
 
320 aa  95.5  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  27.18 
 
 
320 aa  92.8  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  26.73 
 
 
315 aa  92.4  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  27.22 
 
 
319 aa  92  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  27.18 
 
 
320 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  26.86 
 
 
320 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  26.86 
 
 
320 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  26.64 
 
 
315 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  28.76 
 
 
309 aa  89.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  28.76 
 
 
309 aa  89.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  25.88 
 
 
320 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  27.45 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  27.27 
 
 
315 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  26.37 
 
 
320 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  26.37 
 
 
320 aa  87.4  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  25.68 
 
 
311 aa  85.9  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  28.25 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  25.67 
 
 
314 aa  83.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  23.72 
 
 
325 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  28.43 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  28.48 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  26.99 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  26.58 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  26.8 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  27.06 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  23.97 
 
 
311 aa  80.1  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  26.06 
 
 
317 aa  79  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  22.37 
 
 
322 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  25.25 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  24.57 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  26.62 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  23.47 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  28.34 
 
 
315 aa  72.4  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  27.54 
 
 
320 aa  72.4  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  25.33 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  26.87 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  30.73 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0268  putative MdcF malonate transporter  28 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.359135  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  27.01 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  28.47 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  25.08 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2077  Auxin Efflux Carrier  28.67 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.393578  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  25.74 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  29.53 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  25.52 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  26.01 
 
 
324 aa  70.1  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2607  auxin efflux carrier  26.32 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10012  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  26.05 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  27.87 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  24.01 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  27.16 
 
 
318 aa  68.9  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  24.91 
 
 
312 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  26.62 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  24.91 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  33.33 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  28.24 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  25.77 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  26.22 
 
 
297 aa  67  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  27.36 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  25.76 
 
 
318 aa  67  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  27.49 
 
 
329 aa  66.6  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.42 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  29.9 
 
 
340 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  25.42 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  29.24 
 
 
317 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  24.58 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  27.65 
 
 
315 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  25.57 
 
 
322 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  29.9 
 
 
294 aa  63.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  27.21 
 
 
318 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  27.68 
 
 
304 aa  63.9  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  32.67 
 
 
305 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  24.29 
 
 
313 aa  63.2  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  32 
 
 
308 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>