155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0034 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0034  auxin efflux carrier  100 
 
 
279 aa  543  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  48.92 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1014  Auxin Efflux Carrier  39.84 
 
 
306 aa  179  5.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152875  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  36 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  35.55 
 
 
313 aa  169  6e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  36.92 
 
 
314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  39.53 
 
 
307 aa  160  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  37.2 
 
 
309 aa  159  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  32.86 
 
 
290 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  39.06 
 
 
309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  37.5 
 
 
308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  33.57 
 
 
307 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  32.39 
 
 
307 aa  141  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  32.98 
 
 
308 aa  139  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3295  Auxin Efflux Carrier  30.2 
 
 
309 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12560  predicted permease  38.33 
 
 
308 aa  133  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270309  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2397  Auxin Efflux Carrier  40.77 
 
 
308 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2219  Auxin Efflux Carrier  38.57 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  30.57 
 
 
326 aa  115  8.999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  30.58 
 
 
305 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  30.36 
 
 
347 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17720  predicted permease  37.45 
 
 
310 aa  99  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302004  normal  0.264238 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  30.31 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  29.2 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  28.33 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  31.95 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  27.5 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  28.19 
 
 
311 aa  67  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  27.65 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  28.38 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  28.29 
 
 
312 aa  65.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  28.29 
 
 
312 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  29.05 
 
 
314 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  26.56 
 
 
308 aa  63.2  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  25.75 
 
 
315 aa  63.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  30.59 
 
 
311 aa  62.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  30.04 
 
 
314 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  29.86 
 
 
309 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  27.6 
 
 
310 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  25.79 
 
 
309 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4185  auxin efflux carrier  28.43 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  30.28 
 
 
317 aa  59.7  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  32.52 
 
 
309 aa  59.3  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  26.45 
 
 
311 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.61 
 
 
318 aa  59.3  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  27.92 
 
 
318 aa  59.3  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  23.9 
 
 
308 aa  58.9  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  28.33 
 
 
291 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  27.31 
 
 
320 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  25 
 
 
312 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3571  hypothetical protein  29.41 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  25.4 
 
 
318 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  26.32 
 
 
311 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  25.4 
 
 
318 aa  57.4  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42100  hypothetical protein  28.72 
 
 
295 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.4 
 
 
318 aa  57  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  22.03 
 
 
313 aa  56.6  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  28.37 
 
 
309 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  28.37 
 
 
309 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  25.94 
 
 
309 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  25.62 
 
 
318 aa  55.8  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  25.21 
 
 
318 aa  55.5  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  26.51 
 
 
320 aa  55.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  27.07 
 
 
320 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  26.64 
 
 
307 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23880  membrane protein  31.25 
 
 
296 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  25.94 
 
 
293 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  27.86 
 
 
291 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  27.22 
 
 
291 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  27.83 
 
 
291 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  27.83 
 
 
305 aa  53.1  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  26.78 
 
 
324 aa  52.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  27.91 
 
 
372 aa  52.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  26.32 
 
 
291 aa  52.8  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  23.01 
 
 
306 aa  52.8  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0404  Auxin Efflux Carrier  27.78 
 
 
313 aa  52.4  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.989352  normal  0.549528 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  27.01 
 
 
291 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  24.88 
 
 
307 aa  52  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0498  auxin efflux carrier family protein  24.71 
 
 
349 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  26.59 
 
 
318 aa  51.6  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  27.31 
 
 
315 aa  51.6  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  24.51 
 
 
321 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  26.59 
 
 
318 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  25.11 
 
 
315 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  22.26 
 
 
301 aa  52  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  27.88 
 
 
313 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  30.04 
 
 
313 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  26.55 
 
 
317 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  28.95 
 
 
315 aa  51.2  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0509  auxin efflux carrier family protein  24.71 
 
 
349 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0577752  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  25.81 
 
 
315 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  22.71 
 
 
320 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  30.17 
 
 
312 aa  50.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  27.98 
 
 
306 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  25.09 
 
 
315 aa  48.9  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  27.72 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  25 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  26.19 
 
 
304 aa  48.9  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  27.36 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  28.57 
 
 
337 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>