More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_48340 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  100 
 
 
299 aa  568  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  64.53 
 
 
299 aa  332  5e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  35.03 
 
 
367 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  35.22 
 
 
311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  32.81 
 
 
315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  34.81 
 
 
315 aa  124  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  31.05 
 
 
315 aa  122  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  32.68 
 
 
314 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  32.42 
 
 
318 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  32.42 
 
 
318 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  32.42 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  30.9 
 
 
305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  29.97 
 
 
308 aa  120  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  32.33 
 
 
322 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  32.99 
 
 
318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  32.68 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  31.29 
 
 
318 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  31.23 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  31.79 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  31.63 
 
 
318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  31.27 
 
 
308 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  28.81 
 
 
324 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  30.95 
 
 
318 aa  105  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  30.49 
 
 
309 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  33.01 
 
 
316 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  30.49 
 
 
309 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  31.39 
 
 
314 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  30.17 
 
 
329 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  30.16 
 
 
309 aa  102  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  33.01 
 
 
310 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0268  putative MdcF malonate transporter  34.19 
 
 
321 aa  100  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.359135  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  29.56 
 
 
306 aa  100  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  32.41 
 
 
309 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  30.69 
 
 
317 aa  94.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  28.01 
 
 
312 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  31.17 
 
 
311 aa  93.6  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  28.01 
 
 
312 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  32.25 
 
 
342 aa  93.6  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  32.25 
 
 
342 aa  93.2  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  30.36 
 
 
314 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  29.67 
 
 
315 aa  90.9  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  29.49 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  31.15 
 
 
311 aa  90.5  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  32.08 
 
 
311 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  29.35 
 
 
313 aa  89  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  34.68 
 
 
304 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  33.67 
 
 
314 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  31.14 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0231  auxin efflux carrier  33.66 
 
 
318 aa  86.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00153473 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  32.09 
 
 
306 aa  86.7  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  31.65 
 
 
319 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  28.08 
 
 
321 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  29.58 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  29.37 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  31.39 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  29.79 
 
 
325 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  30.52 
 
 
308 aa  83.6  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  30.55 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  30.54 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  28.94 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  29.79 
 
 
362 aa  80.5  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  30.2 
 
 
301 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  32.35 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  30.29 
 
 
330 aa  79.7  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  28.99 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  29.83 
 
 
305 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  32.35 
 
 
318 aa  79  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  28.81 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  29.28 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  28.57 
 
 
330 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  28.73 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  28.62 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  28.43 
 
 
317 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  25.25 
 
 
313 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  23.36 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  26.78 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  27.96 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  26.23 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  28.52 
 
 
301 aa  76.3  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  29.43 
 
 
330 aa  75.9  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  28.53 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  27.97 
 
 
372 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  29.82 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  30.9 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  23.84 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  26.17 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  28.57 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  28 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  30.19 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  30.52 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  28.28 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  27.63 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  23.3 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  28.28 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  26.82 
 
 
313 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  28.76 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  26.76 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  27.96 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  25.33 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  28.46 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>