157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1225 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  100 
 
 		 313 aa  619  1e-176  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  81.35 
 
 		 314 aa  499  1e-140  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1014  Auxin Efflux Carrier  43.58 
 
 		 306 aa  246  4e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152875  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  38.06 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  39.49 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  36.6 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  36.3 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  34.94 
 
 		 307 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  34.55 
 
 		 308 aa  182  7e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  35.54 
 
 		 307 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  37.89 
 
 		 290 aa  178  9e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3295  Auxin Efflux Carrier  34.82 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0034  auxin efflux carrier  35.97 
 
 		 279 aa  169  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  35.37 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  31.89 
 
 		 326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12560  predicted permease  33.66 
 
 		 308 aa  164  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270309  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  34.54 
 
 		 308 aa  162  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  31.17 
 
 		 305 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2397  Auxin Efflux Carrier  33.55 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17720  predicted permease  32.8 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302004  normal  0.264238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  30.4 
 
 		 347 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2219  Auxin Efflux Carrier  29.84 
 
 		 312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  29.64 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  29.08 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  29.74 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  30.07 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  29.41 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  29.08 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  29.78 
 
 		 322 aa  87  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  25.9 
 
 		 318 aa  86.7  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  29.29 
 
 		 318 aa  86.3  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  29.13 
 
 		 320 aa  85.9  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  28.23 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  29.13 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  29.13 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  27.92 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  26.8 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.65 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  27.27 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  26.98 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  25 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  25 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  26.03 
 
 		 311 aa  79  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  26.44 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  25.17 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  28.67 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  27.87 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  26.81 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  27.69 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  24.75 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  25.91 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  24.75 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  28.29 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  26.27 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  25.51 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  25.42 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  27.02 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  25.34 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  24.18 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  27.52 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  28.88 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  24.1 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  24.16 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  27.02 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  24.13 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  22.15 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  25.71 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0268  putative MdcF malonate transporter  26.69 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.359135  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  23.99 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.71 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  26.35 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  24.28 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  26.33 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  25.08 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1197  auxin efflux carrier  25.16 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.793167  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  25.64 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  23.33 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  24.75 
 
 		 311 aa  57  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  24.52 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  23.05 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  23.81 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0231  auxin efflux carrier  25.95 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00153473 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  26.4 
 
 		 316 aa  54.3  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  23.08 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  21.8 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  31.82 
 
 		 316 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  25.82 
 
 		 293 aa  54.3  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  24.44 
 
 		 324 aa  53.5  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  23.59 
 
 		 315 aa  53.5  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  24.56 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  22.88 
 
 		 309 aa  52.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  24.68 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  22.17 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  23.13 
 
 		 315 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  22.74 
 
 		 322 aa  50.8  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  22.83 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  24.83 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003704  membrane protein  23.36 
 
 		 293 aa  50.4  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>