244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1709 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  100 
 
 
304 aa  580  1e-164  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  39.29 
 
 
308 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  39.47 
 
 
307 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  37.04 
 
 
310 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  39.67 
 
 
304 aa  170  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  37.37 
 
 
306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  36.36 
 
 
309 aa  162  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  34.74 
 
 
310 aa  149  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  37.86 
 
 
311 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  33.55 
 
 
305 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  37.97 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  33.77 
 
 
303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  36.6 
 
 
308 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  38.61 
 
 
315 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  35 
 
 
305 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  37.59 
 
 
310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  33.33 
 
 
305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  36.98 
 
 
308 aa  132  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  36.86 
 
 
339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  36.73 
 
 
336 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  36.5 
 
 
336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  36.5 
 
 
336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  27.44 
 
 
306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  34.39 
 
 
315 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  37 
 
 
304 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  32.53 
 
 
303 aa  125  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  34.45 
 
 
297 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  33.33 
 
 
302 aa  123  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  33.68 
 
 
305 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  34.24 
 
 
299 aa  122  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  34.04 
 
 
308 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  37.46 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  37.15 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  32.09 
 
 
350 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  37.12 
 
 
314 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  35.94 
 
 
310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  31.91 
 
 
305 aa  119  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  32.56 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  32.34 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  31.67 
 
 
362 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  32.9 
 
 
330 aa  116  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  31.58 
 
 
305 aa  116  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  30.9 
 
 
317 aa  112  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  38.89 
 
 
300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  34.38 
 
 
305 aa  109  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  32.89 
 
 
312 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  33.79 
 
 
300 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2655  auxin efflux carrier  34.55 
 
 
332 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  31.64 
 
 
273 aa  105  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  29.53 
 
 
307 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  29.51 
 
 
318 aa  98.2  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  32.33 
 
 
305 aa  96.3  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  33.11 
 
 
317 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  36.05 
 
 
301 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  27.72 
 
 
318 aa  92  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  27.43 
 
 
318 aa  92  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  30 
 
 
318 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  29.1 
 
 
318 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  29.9 
 
 
318 aa  89.7  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  26.84 
 
 
330 aa  88.6  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  29.71 
 
 
317 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  27.36 
 
 
319 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  29.33 
 
 
318 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  27.61 
 
 
315 aa  86.7  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3195  auxin efflux carrier  33.11 
 
 
301 aa  85.9  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  28.52 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  29.9 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  28.52 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  26.35 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  28.2 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  30.24 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  28.2 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  30.82 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  27.7 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  29.55 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  26.93 
 
 
332 aa  82  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  29.02 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  28.2 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  28.87 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  28.87 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  28.66 
 
 
318 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  28.43 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  26.32 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  28.71 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  27.5 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  28.97 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  24.28 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  28.43 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  27.36 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  24.85 
 
 
324 aa  72.8  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  29.25 
 
 
320 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  27.93 
 
 
316 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  29.07 
 
 
318 aa  72.4  0.000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  28 
 
 
312 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  29.07 
 
 
318 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  28.11 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  29.07 
 
 
318 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  28 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  29.61 
 
 
301 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  28.3 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>