243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1759 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  631  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  99.37 
 
 		 318 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  99.06 
 
 		 318 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  98.11 
 
 		 318 aa  620  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  91.82 
 
 		 318 aa  587  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  91.19 
 
 		 318 aa  584  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  91.19 
 
 		 318 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  91.19 
 
 		 318 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  93.71 
 
 		 318 aa  579  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  67.61 
 
 		 318 aa  443  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  65.72 
 
 		 330 aa  435  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  60.38 
 
 		 318 aa  403  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  60.69 
 
 		 318 aa  397  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  56.05 
 
 		 316 aa  335  5e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  46.71 
 
 		 318 aa  265  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  40.51 
 
 		 319 aa  249  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  38.61 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  45.4 
 
 		 318 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  43.49 
 
 		 318 aa  235  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  45.4 
 
 		 318 aa  235  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  45.4 
 
 		 318 aa  235  9e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  46.54 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  41.99 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  41.04 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  43.51 
 
 		 313 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  41.88 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  41.88 
 
 		 313 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  42.16 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  42.01 
 
 		 319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  41.88 
 
 		 313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  39.94 
 
 		 316 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  41.37 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  41.01 
 
 		 319 aa  209  6e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  40.2 
 
 		 316 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  40.72 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  43.62 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1780  auxin efflux carrier  44.52 
 
 		 302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0290107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  38.74 
 
 		 312 aa  163  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  35.17 
 
 		 313 aa  158  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  30.48 
 
 		 315 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  32.89 
 
 		 307 aa  116  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  31.75 
 
 		 308 aa  115  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  32.78 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  30.28 
 
 		 310 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  33.21 
 
 		 317 aa  109  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  30 
 
 		 309 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  28.81 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  31.79 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  31.4 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  30.04 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  30.04 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  31.85 
 
 		 305 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  28.87 
 
 		 339 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  29.1 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  29.25 
 
 		 311 aa  100  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  28.42 
 
 		 310 aa  99.8  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  29.11 
 
 		 302 aa  99.8  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  28.47 
 
 		 336 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  29.11 
 
 		 350 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  28.42 
 
 		 306 aa  97.1  4e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  32.25 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  28 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  30.72 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  26.98 
 
 		 312 aa  93.6  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  33.22 
 
 		 314 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  30.77 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  30.77 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  25.33 
 
 		 305 aa  90.9  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  33.1 
 
 		 304 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  28.9 
 
 		 311 aa  89.4  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  26.56 
 
 		 308 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  28.57 
 
 		 303 aa  86.7  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  33.1 
 
 		 301 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  27.34 
 
 		 297 aa  86.7  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  28.43 
 
 		 304 aa  85.9  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  25.41 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  29.79 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  26.04 
 
 		 362 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  25.85 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  31.52 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  26.21 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  28.48 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  26.41 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  28.48 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  28.52 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  27.41 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  26.62 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  28.67 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  27.3 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  24.42 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  25.89 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  25.85 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  23.57 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  25.42 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  24.65 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  26.13 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  26.13 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>