200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0389 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  100 
 
 		 310 aa  566  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  64.86 
 
 		 309 aa  368  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  64.69 
 
 		 310 aa  348  6e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  73.05 
 
 		 273 aa  333  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  64.14 
 
 		 339 aa  325  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  63.49 
 
 		 336 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  63.16 
 
 		 310 aa  319  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  63.49 
 
 		 336 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  63.49 
 
 		 336 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  59.93 
 
 		 305 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  60.76 
 
 		 315 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  60.42 
 
 		 308 aa  295  5e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  60.42 
 
 		 305 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  46.51 
 
 		 302 aa  225  6e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  45.92 
 
 		 306 aa  207  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  42.45 
 
 		 303 aa  207  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  43.52 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  47.02 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  44.19 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  40.27 
 
 		 305 aa  192  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  41.06 
 
 		 305 aa  192  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  44.66 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  46.98 
 
 		 304 aa  187  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  41.72 
 
 		 308 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  33.78 
 
 		 306 aa  176  5e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  41.81 
 
 		 304 aa  172  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  46.69 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  44.3 
 
 		 314 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  36.36 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  44.74 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  37.58 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  46.53 
 
 		 300 aa  159  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  36.21 
 
 		 311 aa  152  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  42 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  42.11 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  38.28 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  35.69 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  36.54 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  34.11 
 
 		 350 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  32 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  35.45 
 
 		 312 aa  119  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  31.27 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  29.12 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  36.14 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  30.24 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  29.68 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  28.71 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  29.55 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  30.32 
 
 		 318 aa  105  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  30 
 
 		 318 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  30 
 
 		 318 aa  105  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  30 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  29.21 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  34.98 
 
 		 318 aa  102  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  34.28 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  32 
 
 		 317 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  30.04 
 
 		 313 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  28.32 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  31.99 
 
 		 362 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  28.67 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  27.62 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  32.68 
 
 		 330 aa  97.4  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  30.03 
 
 		 313 aa  96.7  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  28.62 
 
 		 316 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  26.92 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  27.92 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  26.92 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  25.77 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  26.5 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  33.21 
 
 		 318 aa  93.2  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  33.21 
 
 		 318 aa  93.2  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  28.38 
 
 		 316 aa  92.4  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  26.57 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  33.57 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  30.56 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  30.69 
 
 		 305 aa  89  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  29.51 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  30.9 
 
 		 305 aa  88.2  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  26.48 
 
 		 318 aa  87  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  32.78 
 
 		 305 aa  86.3  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  28.39 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  31.67 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  27.21 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  27.87 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  26.76 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2655  auxin efflux carrier  32.53 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  29.25 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  24.01 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  31.72 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  30.39 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  25.81 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  27.74 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  25.81 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  27.65 
 
 		 316 aa  67  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1484  auxin efflux carrier  33.78 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3195  auxin efflux carrier  30.49 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  25.68 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  25.6 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  28.67 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  27.3 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>