205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2785 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  100 
 
 		 312 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  43.93 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  40.78 
 
 		 330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  38.61 
 
 		 318 aa  218  8.999999999999998e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  40.89 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  39.31 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  38.99 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  38.99 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  38.17 
 
 		 318 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  37.85 
 
 		 318 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  38.68 
 
 		 318 aa  205  7e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  37.22 
 
 		 316 aa  205  8e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  37.74 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  37.85 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  37.54 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  36.98 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  38.31 
 
 		 313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  38.14 
 
 		 313 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  37.58 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  33.75 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  35.86 
 
 		 313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  34.95 
 
 		 315 aa  195  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  34.07 
 
 		 319 aa  195  9e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  37.7 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  35.28 
 
 		 313 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  38.49 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  36.01 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  38.17 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  37.54 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  37.38 
 
 		 316 aa  188  9e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  38.68 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  39.23 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  38.99 
 
 		 318 aa  177  3e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  36.42 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  40.65 
 
 		 316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  36.36 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  35.42 
 
 		 319 aa  151  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  35.03 
 
 		 295 aa  142  8e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1780  auxin efflux carrier  33.78 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0290107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  31.29 
 
 		 315 aa  135  7.000000000000001e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  29.93 
 
 		 309 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  30.54 
 
 		 307 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  32.89 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  30.59 
 
 		 308 aa  99.8  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  33.1 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  33.99 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  30 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  31.4 
 
 		 303 aa  95.5  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  31.27 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  30.37 
 
 		 339 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  27.59 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  24.26 
 
 		 316 aa  93.6  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  26.51 
 
 		 305 aa  93.6  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  30.66 
 
 		 336 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  30.66 
 
 		 336 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  28.01 
 
 		 310 aa  90.1  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  27.89 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  28.52 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  26.35 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  24.83 
 
 		 312 aa  86.3  6e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  26.38 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  29.63 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  29.41 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  26.55 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  29.57 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  28.36 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  25.5 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  32.65 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  31.19 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  27.62 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  22.59 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  23.53 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  31.6 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  25.24 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  25.73 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  24.01 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  28.97 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  27.65 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  31.8 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  30.86 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  26.14 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  28.97 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  27.61 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  30.48 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  26.86 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  26.57 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  25.36 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1484  auxin efflux carrier  28.38 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  26.8 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  26.12 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.73 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  27.34 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  28.53 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  29.06 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  24.76 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0034  auxin efflux carrier  30.17 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  29.43 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  23.78 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  29.49 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>