223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0926 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  100 
 
 		 315 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  99.68 
 
 		 313 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  97.12 
 
 		 313 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  94.57 
 
 		 313 aa  591  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  77 
 
 		 313 aa  477  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  72.84 
 
 		 316 aa  447  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  72.47 
 
 		 316 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  68.37 
 
 		 313 aa  428  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  68.37 
 
 		 313 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  56.83 
 
 		 315 aa  358  4e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  50.32 
 
 		 316 aa  285  9e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  42.9 
 
 		 318 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  39.55 
 
 		 318 aa  220  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  42.21 
 
 		 318 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  41.88 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  41.88 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  41.88 
 
 		 318 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  39.75 
 
 		 318 aa  216  5e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  41.2 
 
 		 318 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  41.18 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  39.61 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  41.35 
 
 		 330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  40.53 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  40.53 
 
 		 318 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  38.56 
 
 		 319 aa  209  6e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  41.23 
 
 		 318 aa  205  6e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  36.93 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  39.02 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  40.26 
 
 		 316 aa  182  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  37.42 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  35.66 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  37.38 
 
 		 318 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  37.38 
 
 		 318 aa  166  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  37.7 
 
 		 318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  37.77 
 
 		 319 aa  159  6e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  35.27 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  34.13 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  38.13 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1780  auxin efflux carrier  37 
 
 		 302 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0290107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  31.11 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  36.91 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  29.43 
 
 		 308 aa  122  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  29.19 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  30.03 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  32.67 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  28.72 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  29.72 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  31.93 
 
 		 339 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  31.27 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  27.11 
 
 		 312 aa  97.4  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  28.05 
 
 		 307 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  31.67 
 
 		 310 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  31.07 
 
 		 336 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  31.79 
 
 		 336 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  31.79 
 
 		 336 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  31.23 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  30.62 
 
 		 311 aa  93.6  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  29.35 
 
 		 310 aa  93.2  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  27.21 
 
 		 310 aa  92.4  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  30 
 
 		 307 aa  92.4  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  29.9 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  32.38 
 
 		 308 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  32.38 
 
 		 315 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  28.11 
 
 		 303 aa  89.4  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  29.83 
 
 		 299 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  27.57 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  26.33 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  23.61 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  25.51 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  31.94 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  26.88 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  31.61 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  24.84 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  27.04 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  25.33 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  29.9 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  25.56 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  30.48 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  28.33 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  30.27 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  26.8 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1484  auxin efflux carrier  29.41 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  31.58 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  28.08 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  22.3 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  25.09 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  23.66 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  27.74 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  23.92 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  25.25 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  26.75 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  25.71 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  26.6 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  25.09 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  25.09 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  29.27 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  28.64 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  31.06 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  23.67 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>