247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1654 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  100 
 
 		 318 aa  631  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  99.69 
 
 		 318 aa  630  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  99.37 
 
 		 318 aa  629  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  98.11 
 
 		 318 aa  619  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  92.45 
 
 		 318 aa  588  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  91.82 
 
 		 318 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  91.82 
 
 		 318 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  91.82 
 
 		 318 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  94.03 
 
 		 318 aa  579  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  67.92 
 
 		 318 aa  444  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  66.04 
 
 		 330 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  60.69 
 
 		 318 aa  404  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  61.32 
 
 		 318 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  56.37 
 
 		 316 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  47.34 
 
 		 318 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  40.51 
 
 		 319 aa  249  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  38.61 
 
 		 319 aa  246  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  43.49 
 
 		 318 aa  236  5.0000000000000005e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  45.4 
 
 		 318 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  45.4 
 
 		 318 aa  235  8e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  45.4 
 
 		 318 aa  235  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  46.23 
 
 		 316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  41.67 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  40.72 
 
 		 315 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  43.83 
 
 		 313 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  42.21 
 
 		 313 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  42.21 
 
 		 315 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  42.16 
 
 		 313 aa  215  8e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  41.88 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  41.69 
 
 		 319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  39.62 
 
 		 316 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  41.37 
 
 		 313 aa  210  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  41.01 
 
 		 319 aa  209  6e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  40.52 
 
 		 316 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  41.04 
 
 		 316 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1780  auxin efflux carrier  44.19 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0290107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  43.29 
 
 		 295 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  38.41 
 
 		 312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  35.17 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  30.48 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  32.06 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  32.23 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  30.18 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  32.76 
 
 		 308 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  33.21 
 
 		 317 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  30 
 
 		 309 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  28.81 
 
 		 310 aa  106  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  31.79 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  31.85 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  31.06 
 
 		 303 aa  103  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  29.54 
 
 		 336 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  29.54 
 
 		 336 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  29.1 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  29.25 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  28.72 
 
 		 339 aa  99.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  29.11 
 
 		 350 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  28.77 
 
 		 302 aa  100  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  28.47 
 
 		 310 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 336 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  28.08 
 
 		 306 aa  95.9  7e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  31.92 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  30.72 
 
 		 305 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  27.3 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  27.67 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 312 aa  92.4  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  33.22 
 
 		 314 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  30.77 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  25.33 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  33.1 
 
 		 304 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  30.77 
 
 		 308 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  29.29 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  26.56 
 
 		 308 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  28.76 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  28.91 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  33.1 
 
 		 301 aa  87  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  27.34 
 
 		 297 aa  87  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  25.85 
 
 		 301 aa  86.3  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  29.43 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  25.41 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  25.69 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  31.52 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  26.21 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  28.85 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  26.41 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  28.48 
 
 		 315 aa  82.4  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  28.52 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  27.8 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  28.15 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  26.28 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  28.67 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.96 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  24.42 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  25.42 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  26.45 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  26.45 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  23.89 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  24.65 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  25.85 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  25.57 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>