229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4722 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  588  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  61.51 
 
 		 308 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  49.35 
 
 		 315 aa  245  8e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  42.72 
 
 		 306 aa  199  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  40.73 
 
 		 309 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  43.51 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  40.86 
 
 		 311 aa  196  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  44.82 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  40.49 
 
 		 310 aa  192  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  40.28 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  40.28 
 
 		 336 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  40.14 
 
 		 339 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  41.5 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  39.93 
 
 		 336 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  39.93 
 
 		 336 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  41.81 
 
 		 305 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  39.34 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  41.82 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  40.27 
 
 		 304 aa  176  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  36.48 
 
 		 305 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  41.45 
 
 		 308 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  39.47 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  42.55 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  38.16 
 
 		 303 aa  172  7.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  42.96 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  40.5 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  42.6 
 
 		 304 aa  165  8e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  34.71 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  37.25 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  35.29 
 
 		 310 aa  156  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  31.1 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  37.69 
 
 		 273 aa  145  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  33.89 
 
 		 299 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  38.69 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  38.8 
 
 		 314 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  36.39 
 
 		 297 aa  132  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  35.43 
 
 		 330 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  38.97 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  31.72 
 
 		 315 aa  129  9.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  35.43 
 
 		 350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  33.11 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  32.89 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  32.57 
 
 		 362 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  32.33 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  32.23 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  32.25 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  39.38 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  32.23 
 
 		 318 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  31.92 
 
 		 318 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  31.92 
 
 		 318 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  32.33 
 
 		 318 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  36.13 
 
 		 305 aa  122  9e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  36.96 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  33.11 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  34.31 
 
 		 300 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  31.77 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  32.89 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  31.51 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  31.89 
 
 		 318 aa  112  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  33.11 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  29.77 
 
 		 330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  30.92 
 
 		 313 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  27.85 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  30.59 
 
 		 313 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2655  auxin efflux carrier  33.11 
 
 		 332 aa  102  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  30 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  30 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  26.6 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  29 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  28.24 
 
 		 315 aa  97.1  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  28.62 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  29.04 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  26.6 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  28.87 
 
 		 318 aa  93.2  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  28.95 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  33.01 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  30.46 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  28.81 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  28.47 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  26.38 
 
 		 315 aa  90.9  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  28.23 
 
 		 319 aa  89.4  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  30.82 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3195  auxin efflux carrier  33.22 
 
 		 301 aa  87  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  30.03 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  30.63 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  28.11 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  26.86 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  32.42 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  31.37 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  32.42 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  32.88 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  31.37 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  28.68 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  31.5 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  26.45 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  26.45 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  27.72 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  27.84 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  27.66 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  27.12 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>