204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0363 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 315 aa  586  1e-166  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  62.09 
 
 		 304 aa  335  9e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  48.85 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  51.3 
 
 		 305 aa  239  4e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1093  hypothetical protein  41.85 
 
 		 313 aa  177  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.795782  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  29.82 
 
 		 302 aa  123  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  33.21 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  37.79 
 
 		 318 aa  102  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  32.13 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  26.04 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  30.42 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  29.18 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  34.13 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  25.55 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  27.6 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  25.76 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  27.81 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  29.93 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.25 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  28.67 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  31.02 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  29.97 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  24.76 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  30.74 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  31.68 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  25.28 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0577  auxin efflux carrier  32.35 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  29.07 
 
 		 310 aa  67  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  24.57 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  27.83 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  25.86 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3336  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 321 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  29.49 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  29.95 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  26.64 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  24.84 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  28.01 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  24.91 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  26.19 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  24.05 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  29.39 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  27.95 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  27.46 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  27.67 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  28.71 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  27.95 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  27.94 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  27.52 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  27.71 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  28.33 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  25 
 
 		 301 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  28.47 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  28.48 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  26.01 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  27.15 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  25.35 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  27.7 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  28.9 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  31.16 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  25.69 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  29.14 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  28.73 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  25.99 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  28.35 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2190  auxin efflux carrier  31.01 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  30.27 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  25.64 
 
 		 328 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  30.3 
 
 		 330 aa  57  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  27.33 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  25.32 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  28.68 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  28.99 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  28.31 
 
 		 308 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  24.32 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  32.13 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  27.56 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0521  auxin efflux carrier family protein  28.52 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  28.94 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1460  putative auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0835  putative auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1848  auxin efflux carrier, putative  28.52 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  23.41 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  27.52 
 
 		 317 aa  55.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  29.9 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2151  putative auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0424  auxin efflux carrier family protein  28.52 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  23.55 
 
 		 301 aa  54.7  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  31.6 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  28.36 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2607  auxin efflux carrier  28.05 
 
 		 319 aa  55.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10012  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  24.26 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  26.36 
 
 		 301 aa  54.3  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0268  putative MdcF malonate transporter  27.24 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.359135  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1242  auxin efflux carrier  29.07 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.115852  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  28.9 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  27.7 
 
 		 297 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  28.57 
 
 		 307 aa  53.9  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>