254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0872 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  100 
 
 
308 aa  583  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  64 
 
 
311 aa  328  5.0000000000000004e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  44.52 
 
 
310 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  47.02 
 
 
308 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  46.15 
 
 
310 aa  212  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  45.45 
 
 
336 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  45.8 
 
 
339 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  44.41 
 
 
336 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  44.41 
 
 
336 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  42.67 
 
 
302 aa  199  6e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  40.26 
 
 
310 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  42.62 
 
 
309 aa  195  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  40.97 
 
 
305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  41.78 
 
 
308 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  43.51 
 
 
307 aa  188  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  42.57 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  41.61 
 
 
305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  44.21 
 
 
304 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  42.27 
 
 
315 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  42.95 
 
 
306 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  41.92 
 
 
308 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  44.81 
 
 
304 aa  176  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  42.27 
 
 
305 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  44.33 
 
 
310 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  42.09 
 
 
304 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  38.33 
 
 
303 aa  166  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  39.93 
 
 
304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  38.62 
 
 
303 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  42.27 
 
 
314 aa  165  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  43.34 
 
 
301 aa  159  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  34.55 
 
 
306 aa  159  8e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  45.3 
 
 
300 aa  152  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  39.14 
 
 
315 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  38.19 
 
 
311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  39.31 
 
 
273 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  35.33 
 
 
315 aa  139  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  34.53 
 
 
350 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  35.76 
 
 
297 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  36.09 
 
 
312 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  36.6 
 
 
304 aa  130  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  34.93 
 
 
305 aa  123  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  29.76 
 
 
318 aa  122  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  30.33 
 
 
318 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  32.24 
 
 
305 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  31.65 
 
 
330 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  35.43 
 
 
299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  31.43 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  36.3 
 
 
300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  31.75 
 
 
318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  31.43 
 
 
318 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  31.75 
 
 
318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  32.66 
 
 
362 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  32.06 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  32.46 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  32.06 
 
 
318 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  32.06 
 
 
318 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  31.7 
 
 
317 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  33.56 
 
 
318 aa  116  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  34.72 
 
 
318 aa  116  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  33.56 
 
 
318 aa  116  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  31.75 
 
 
318 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  34.27 
 
 
318 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  31.13 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  33.44 
 
 
301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  30.54 
 
 
316 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  31.46 
 
 
316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  30.2 
 
 
313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  28.07 
 
 
318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  31.56 
 
 
318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  29.19 
 
 
313 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  29.19 
 
 
315 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  28.86 
 
 
313 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  31.35 
 
 
318 aa  106  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  28.67 
 
 
330 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  29.49 
 
 
316 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  29.43 
 
 
313 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  30.9 
 
 
313 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  31.14 
 
 
319 aa  102  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  26.47 
 
 
315 aa  102  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  29.23 
 
 
319 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  27.99 
 
 
316 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2655  auxin efflux carrier  32.24 
 
 
332 aa  96.3  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  29.04 
 
 
315 aa  95.1  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  27.13 
 
 
307 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  33.44 
 
 
305 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  28.01 
 
 
308 aa  89.4  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  28.66 
 
 
315 aa  85.9  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  26.3 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  28.03 
 
 
315 aa  82.4  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  29.21 
 
 
316 aa  82  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  30.7 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1484  auxin efflux carrier  31.41 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3195  auxin efflux carrier  32.45 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  28.89 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  29.37 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  29.82 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  27.33 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  30.66 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  29.39 
 
 
295 aa  76.3  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  29.24 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>