214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0523 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  100 
 
 		 350 aa  700    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  83.33 
 
 		 312 aa  488  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  49.32 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  43.89 
 
 		 317 aa  229  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  46.13 
 
 		 300 aa  225  9e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  44.33 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  45.02 
 
 		 297 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  43.43 
 
 		 330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  40.6 
 
 		 362 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  44.68 
 
 		 305 aa  212  9e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  42.38 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  42.05 
 
 		 305 aa  212  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  43.56 
 
 		 305 aa  200  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2655  auxin efflux carrier  42.36 
 
 		 332 aa  189  8e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3195  auxin efflux carrier  44.56 
 
 		 301 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  36 
 
 		 309 aa  153  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  38.1 
 
 		 305 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  38.76 
 
 		 302 aa  149  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  35.59 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  35.02 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  36.58 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  38.01 
 
 		 308 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  37.64 
 
 		 315 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  35 
 
 		 310 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  37.54 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  34.53 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  34.44 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  37.5 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  38.64 
 
 		 304 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  32.96 
 
 		 339 aa  135  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  34.97 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  35.19 
 
 		 311 aa  133  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  33.33 
 
 		 336 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  33.33 
 
 		 336 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  34.97 
 
 		 308 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  35.42 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  35.07 
 
 		 314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  35.81 
 
 		 304 aa  130  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  34.34 
 
 		 311 aa  125  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  35.43 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  32.89 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  32.55 
 
 		 305 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  36.55 
 
 		 304 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  32.09 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  37.41 
 
 		 301 aa  113  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  32.49 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  27.53 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  35.25 
 
 		 273 aa  110  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  34.71 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  28.96 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  31.58 
 
 		 303 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  29.59 
 
 		 318 aa  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  30.39 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  28.06 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  27.74 
 
 		 315 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  28.53 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  30.61 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  29.11 
 
 		 318 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  29.11 
 
 		 318 aa  99.8  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  29.11 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  30.45 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  27.8 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  35.79 
 
 		 315 aa  97.4  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  28.77 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  28.77 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  26.11 
 
 		 315 aa  97.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  28.42 
 
 		 318 aa  96.3  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  27.52 
 
 		 318 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  28.98 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  25.43 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  30.22 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  26.69 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  32.99 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  29.89 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  24.6 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2151  Auxin Efflux Carrier  30.96 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  28.73 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  28.73 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  29.15 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  29.09 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  25.68 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  28.76 
 
 		 313 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  27.34 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  30.25 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  26.99 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  26.03 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  28.39 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  24.31 
 
 		 308 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  26.6 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  29.03 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  25.57 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  26.26 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  26.28 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  25.93 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  27.36 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  27.99 
 
 		 313 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1780  auxin efflux carrier  29.64 
 
 		 302 aa  67  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0290107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  26.45 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>