206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1694 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 
303 aa  593  1e-168  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  59.41 
 
 
306 aa  342  7e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  44.03 
 
 
306 aa  226  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  40.14 
 
 
302 aa  206  3e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  36.77 
 
 
305 aa  192  6e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  40.58 
 
 
303 aa  187  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  38.62 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  35.4 
 
 
305 aa  182  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  34.91 
 
 
310 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  36.11 
 
 
309 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  39.26 
 
 
307 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  34.67 
 
 
339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  38.51 
 
 
304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  40.74 
 
 
304 aa  172  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  37.38 
 
 
305 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  38.14 
 
 
315 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  34.58 
 
 
308 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  33.94 
 
 
336 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  33.94 
 
 
336 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  38.23 
 
 
314 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  37.8 
 
 
308 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  34.07 
 
 
336 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  34.43 
 
 
310 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  37.8 
 
 
305 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  36.68 
 
 
310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  36.9 
 
 
308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  39.39 
 
 
304 aa  163  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  36.24 
 
 
304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  37.05 
 
 
311 aa  159  8e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  35.16 
 
 
310 aa  156  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  32.94 
 
 
273 aa  145  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  32.53 
 
 
304 aa  145  9e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  38.05 
 
 
301 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  32.59 
 
 
307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  35.99 
 
 
300 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  33.99 
 
 
315 aa  136  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  32.76 
 
 
297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  35.74 
 
 
315 aa  129  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  30.69 
 
 
316 aa  125  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  29.62 
 
 
330 aa  125  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  31.27 
 
 
299 aa  122  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  29.66 
 
 
318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  28.92 
 
 
305 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  30.72 
 
 
311 aa  119  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  31.06 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  28.87 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  31.06 
 
 
318 aa  116  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  30.56 
 
 
350 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  30.72 
 
 
318 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  30.72 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  31.4 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  31.82 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  31.06 
 
 
318 aa  114  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  31.06 
 
 
318 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  30.38 
 
 
318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  28.22 
 
 
362 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  28.22 
 
 
301 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  30.94 
 
 
300 aa  105  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  29.9 
 
 
318 aa  103  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  27.99 
 
 
319 aa  102  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  30.68 
 
 
305 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  29.69 
 
 
312 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  28.72 
 
 
317 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  28.92 
 
 
318 aa  97.4  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  27.7 
 
 
319 aa  95.5  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  30.27 
 
 
317 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2655  auxin efflux carrier  27.18 
 
 
332 aa  94  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  28.22 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  32.68 
 
 
316 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  33.16 
 
 
316 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  26.87 
 
 
313 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  26.87 
 
 
315 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  26.87 
 
 
308 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  27.66 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  27.27 
 
 
313 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  26.94 
 
 
313 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  30.3 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  27.4 
 
 
313 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  27.37 
 
 
318 aa  84  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  27.3 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  24.75 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  24.75 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  26.51 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  32.68 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  32.68 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  25.91 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3195  auxin efflux carrier  28.57 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  26.37 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  25.85 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  28.95 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  30.58 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  33.17 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  28.95 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  26.87 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  25.91 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  25.84 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  24.83 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  33.12 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  24.92 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  27.84 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>