221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0849 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  100 
 
 
313 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  72.2 
 
 
313 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  69.97 
 
 
313 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  69.97 
 
 
313 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  69.01 
 
 
313 aa  417  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  68.69 
 
 
313 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  68.37 
 
 
315 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  66.77 
 
 
316 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  66.13 
 
 
316 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  60.38 
 
 
315 aa  376  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  56.81 
 
 
316 aa  322  6e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  39.87 
 
 
318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  40.78 
 
 
318 aa  212  9e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  40.79 
 
 
318 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  42.57 
 
 
318 aa  210  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  41.37 
 
 
318 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  40.46 
 
 
318 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  41.37 
 
 
318 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  41.37 
 
 
318 aa  209  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  40.46 
 
 
318 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  40.72 
 
 
318 aa  206  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  40.39 
 
 
318 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  40.73 
 
 
316 aa  204  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  38.89 
 
 
318 aa  203  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  38.06 
 
 
318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  38.28 
 
 
319 aa  199  7e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  38.28 
 
 
319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  42.72 
 
 
316 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  39.54 
 
 
330 aa  191  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  39.45 
 
 
318 aa  175  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  34.04 
 
 
313 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  38.28 
 
 
318 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  38.28 
 
 
318 aa  163  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  38.28 
 
 
318 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  37.38 
 
 
319 aa  160  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  35.84 
 
 
319 aa  158  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  37.04 
 
 
295 aa  157  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  38.68 
 
 
312 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1780  auxin efflux carrier  37.21 
 
 
302 aa  154  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0290107  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  31.79 
 
 
315 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  36.43 
 
 
317 aa  113  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  31.13 
 
 
302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  26.35 
 
 
312 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  30.9 
 
 
308 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  29.17 
 
 
309 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  30.66 
 
 
339 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  31.1 
 
 
336 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  31.1 
 
 
336 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  30.39 
 
 
336 aa  99.4  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  30.39 
 
 
310 aa  99.8  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  30.33 
 
 
301 aa  95.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  31.54 
 
 
308 aa  94.7  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  26.74 
 
 
310 aa  94  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  30.8 
 
 
305 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  27.87 
 
 
307 aa  92.4  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  31.12 
 
 
315 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  31.12 
 
 
308 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  29.57 
 
 
362 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  30.3 
 
 
308 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  25.17 
 
 
308 aa  87.8  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  30.39 
 
 
305 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  27.91 
 
 
330 aa  87.4  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  30.32 
 
 
310 aa  87  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  29.21 
 
 
303 aa  86.7  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  30.98 
 
 
311 aa  85.9  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  31.4 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  28.52 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  30.46 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  28.18 
 
 
305 aa  83.6  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  31.08 
 
 
306 aa  82  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  29.9 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  25.42 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  28.34 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.35 
 
 
318 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  26.67 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  26.67 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  32.45 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  27.24 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  27.74 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  27.15 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  32.24 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  29.93 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  27.7 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  25.59 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  30.24 
 
 
304 aa  73.9  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  27.69 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  25.99 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  24.22 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  24.47 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  28.23 
 
 
306 aa  72  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3195  auxin efflux carrier  28 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  30.04 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  31.74 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  25.79 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  27.27 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  26.03 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  27.13 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.91 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  29.47 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  28.97 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>