239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1298 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  99.69 
 
 		 318 aa  621  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  99.69 
 
 		 318 aa  622  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  100 
 
 		 318 aa  623  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  83.96 
 
 		 318 aa  487  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  69.91 
 
 		 319 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  69.28 
 
 		 319 aa  442  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  45.4 
 
 		 318 aa  270  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  45.4 
 
 		 318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  45.4 
 
 		 318 aa  269  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  45.4 
 
 		 318 aa  269  5e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  44.34 
 
 		 318 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  44.13 
 
 		 318 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  44.44 
 
 		 318 aa  258  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  44.13 
 
 		 318 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  44.13 
 
 		 318 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  43.81 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  42.77 
 
 		 318 aa  249  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  43.63 
 
 		 330 aa  249  5e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  41.99 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  40.63 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  46.2 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  40.25 
 
 		 316 aa  223  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  43.37 
 
 		 319 aa  220  3e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  43.17 
 
 		 319 aa  215  7e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1780  auxin efflux carrier  46.8 
 
 		 302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0290107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  40.33 
 
 		 313 aa  209  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  43.1 
 
 		 295 aa  205  7e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  38.28 
 
 		 316 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  38.49 
 
 		 313 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  37.5 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  38.28 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  37.38 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  37.5 
 
 		 316 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  37.5 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  41.08 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  38.36 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  38.24 
 
 		 315 aa  192  6e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  40.33 
 
 		 313 aa  183  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  38.28 
 
 		 312 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  30.16 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  35.69 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  34.32 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  34.6 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  34.14 
 
 		 311 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  36.54 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  31.77 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  31.02 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  30.66 
 
 		 336 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  36.21 
 
 		 305 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  32.65 
 
 		 302 aa  105  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  31.85 
 
 		 307 aa  105  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  30.8 
 
 		 339 aa  105  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  34.47 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  34.47 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  29.71 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  29.71 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  30.82 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  29.03 
 
 		 305 aa  99.4  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  31.19 
 
 		 311 aa  98.2  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  30.23 
 
 		 305 aa  97.4  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  33.1 
 
 		 310 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  34.45 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  25.09 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  29.11 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  30.1 
 
 		 308 aa  93.2  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  29.08 
 
 		 303 aa  92.4  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  30.38 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  30.72 
 
 		 307 aa  90.5  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  33.33 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  27.87 
 
 		 303 aa  87  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  29.39 
 
 		 300 aa  87.4  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  29.39 
 
 		 312 aa  86.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  28.91 
 
 		 350 aa  87  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  26.8 
 
 		 315 aa  85.9  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  28.37 
 
 		 362 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  30.38 
 
 		 330 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  26.8 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  29.7 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  30.39 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  28.08 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  32.87 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  27.37 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  28.52 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  27.76 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  25.93 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.52 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  30 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  25.9 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  30.37 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  26.97 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  27.4 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1484  auxin efflux carrier  29.67 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  33.1 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  22.15 
 
 		 312 aa  78.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  27.87 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  26.89 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  27.06 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  27.48 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>