163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0818 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 273 aa  526  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  73.05 
 
 		 310 aa  323  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  60.44 
 
 		 309 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  62.5 
 
 		 336 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  61.33 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  60.94 
 
 		 339 aa  286  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  60.94 
 
 		 336 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  60.94 
 
 		 336 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  58.82 
 
 		 310 aa  281  7.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  60.44 
 
 		 305 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  59.22 
 
 		 305 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  58.82 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  58.43 
 
 		 308 aa  255  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  39.85 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  38.1 
 
 		 303 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  41.18 
 
 		 306 aa  171  9e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  37.22 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  38.66 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  45.45 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  38.01 
 
 		 305 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  38.77 
 
 		 308 aa  158  9e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  39.34 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  39.05 
 
 		 304 aa  155  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  33.21 
 
 		 306 aa  152  4e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  43.8 
 
 		 304 aa  149  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  34.2 
 
 		 303 aa  148  9e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  37.87 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  33.82 
 
 		 310 aa  142  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  37.87 
 
 		 314 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  37.45 
 
 		 311 aa  139  7e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  34.81 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  42.59 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  38.83 
 
 		 301 aa  132  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  36.7 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  34.57 
 
 		 350 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  31.99 
 
 		 311 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  34.08 
 
 		 297 aa  118  9e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  34.21 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  36.4 
 
 		 315 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  31.25 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  34.52 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  31.97 
 
 		 362 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  31.11 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  26.26 
 
 		 307 aa  99  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  29.67 
 
 		 318 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  28.2 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  28.2 
 
 		 318 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  29.67 
 
 		 318 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  27.82 
 
 		 318 aa  97.1  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  28.2 
 
 		 318 aa  97.1  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  29.3 
 
 		 318 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  28.94 
 
 		 318 aa  95.9  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  28.46 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  27.61 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  26.59 
 
 		 313 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  28.83 
 
 		 305 aa  89.7  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  30.07 
 
 		 305 aa  89.7  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  33.21 
 
 		 305 aa  89.7  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  29.21 
 
 		 316 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  30 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  28.3 
 
 		 316 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  26.49 
 
 		 330 aa  85.5  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  29.15 
 
 		 313 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  27.34 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  27.44 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  24.91 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  27.34 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  27.72 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  28.09 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  27.72 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  26.97 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  29.26 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  26.49 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  32.67 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  27.21 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  30.77 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  28.09 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  31.64 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  25.09 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  25.75 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  25.93 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  30.5 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  30.5 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  27.36 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  32.51 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  30.89 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  24.48 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2655  auxin efflux carrier  30 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3195  auxin efflux carrier  31.73 
 
 		 301 aa  67  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  27.24 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  26.52 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  30 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  24.03 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  25.78 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  29.21 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  27.86 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  27.86 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  25.21 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.86 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>