241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1191 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  100 
 
 
318 aa  623  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  99.69 
 
 
318 aa  622  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  99.37 
 
 
318 aa  620  1e-176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  83.65 
 
 
318 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  69.59 
 
 
319 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  68.97 
 
 
319 aa  441  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  45.4 
 
 
318 aa  270  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  45.4 
 
 
318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  45.4 
 
 
318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  45.4 
 
 
318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  44.34 
 
 
318 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  44.44 
 
 
318 aa  258  8e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  44.13 
 
 
318 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  44.13 
 
 
318 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  44.13 
 
 
318 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  43.81 
 
 
318 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  42.77 
 
 
318 aa  250  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  43.63 
 
 
330 aa  249  5e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  42.31 
 
 
318 aa  245  8e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  40.95 
 
 
318 aa  245  9e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  45.89 
 
 
316 aa  225  6e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  40.25 
 
 
316 aa  224  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  43.69 
 
 
319 aa  221  9.999999999999999e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  43.49 
 
 
319 aa  216  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1780  auxin efflux carrier  47.14 
 
 
302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0290107  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  40.66 
 
 
313 aa  209  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  38.61 
 
 
316 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  43.43 
 
 
295 aa  206  6e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  38.82 
 
 
313 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  37.7 
 
 
313 aa  198  9e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  37.83 
 
 
316 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  37.83 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  37.83 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  38.28 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  38.36 
 
 
313 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  41.08 
 
 
316 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  38.24 
 
 
315 aa  193  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  40 
 
 
313 aa  182  6e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  38.61 
 
 
312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  30.48 
 
 
315 aa  152  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  36.04 
 
 
308 aa  139  7e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  34.65 
 
 
309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  34.95 
 
 
308 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  34.48 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  36.88 
 
 
305 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  32.13 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  31.39 
 
 
310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  36.55 
 
 
305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  31.02 
 
 
336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  32.99 
 
 
302 aa  107  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  31.16 
 
 
339 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  32.19 
 
 
307 aa  106  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  34.81 
 
 
308 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  34.81 
 
 
315 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  30.07 
 
 
336 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  30.07 
 
 
336 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  31.16 
 
 
297 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  29.35 
 
 
305 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  31.51 
 
 
311 aa  99.4  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  33.45 
 
 
310 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  29.9 
 
 
305 aa  95.9  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  29.45 
 
 
310 aa  95.9  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  30.43 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  33.97 
 
 
317 aa  94.4  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  25.09 
 
 
306 aa  93.6  4e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  29.82 
 
 
303 aa  93.2  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  30.72 
 
 
306 aa  92.8  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  31.05 
 
 
307 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  33.68 
 
 
314 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  33.68 
 
 
304 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  29.73 
 
 
312 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  29.25 
 
 
350 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  28.32 
 
 
303 aa  88.2  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  29.03 
 
 
300 aa  85.9  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  28.03 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  26.47 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  30.03 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  29.7 
 
 
304 aa  83.6  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  28.86 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  28.86 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  26.47 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  33.22 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  26.26 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.86 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  30.04 
 
 
305 aa  82  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  27.74 
 
 
305 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  30.74 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  28.11 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  30 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  27.02 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1484  auxin efflux carrier  31.56 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  26.23 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  22.49 
 
 
312 aa  79.7  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  28.2 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  26.97 
 
 
317 aa  79.3  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  27.39 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  33.45 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  27.05 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  27.81 
 
 
308 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  26.56 
 
 
313 aa  77  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>