153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1780 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1780  auxin efflux carrier  100 
 
 		 302 aa  594  1e-169  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0290107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  67.11 
 
 		 295 aa  375  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  67.11 
 
 		 319 aa  372  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  44 
 
 		 319 aa  235  7e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  44.56 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  39.53 
 
 		 319 aa  222  7e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  45.76 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  44.85 
 
 		 318 aa  219  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  46.8 
 
 		 318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  44.52 
 
 		 318 aa  219  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  46.8 
 
 		 318 aa  219  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  44.52 
 
 		 318 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  47.14 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  44.48 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  41.02 
 
 		 330 aa  210  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  42.47 
 
 		 318 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  41.72 
 
 		 318 aa  209  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  40.54 
 
 		 318 aa  207  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  41.95 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  41.95 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  38.93 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  41.61 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  41.22 
 
 		 316 aa  199  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  42.47 
 
 		 318 aa  197  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  41.53 
 
 		 318 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  39.27 
 
 		 313 aa  189  7e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  40.92 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  39.6 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  38.33 
 
 		 316 aa  179  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  38.28 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  37.29 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  36.96 
 
 		 316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  35.62 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  37.67 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  37.67 
 
 		 315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  37.54 
 
 		 313 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  37.09 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  34.64 
 
 		 312 aa  125  9e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  33.09 
 
 		 313 aa  122  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  28.04 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  32.87 
 
 		 317 aa  96.3  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  29.79 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  28.67 
 
 		 330 aa  89.7  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  28.96 
 
 		 362 aa  89  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  28.85 
 
 		 317 aa  87  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  28.91 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  29.11 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  26.57 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  30.6 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  28.22 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  29.11 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  29.11 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  28.22 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  24.73 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  30.04 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  31.14 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1484  auxin efflux carrier  26.07 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  29.14 
 
 		 350 aa  75.9  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  26.69 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  29.68 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  30.8 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  29.74 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  29.27 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  28.37 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  29.33 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  27.92 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  25.19 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  27.66 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  23.76 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  28.97 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  26.95 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  25.93 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  27.36 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  29.17 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  26.83 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  25.75 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  27.7 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  28.02 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  24.73 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  22.59 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  33.85 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  29.55 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  25.78 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  28.02 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2151  Auxin Efflux Carrier  27.56 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  24.21 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  27.65 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  24.09 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3195  auxin efflux carrier  27.36 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  25.52 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  25.66 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  23.59 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  28.32 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  24.91 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  23.76 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  25.18 
 
 		 303 aa  57  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  30 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  24.83 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>