237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0109 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  659    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  73.27 
 
 		 318 aa  462  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  66.35 
 
 		 318 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  66.98 
 
 		 318 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  66.98 
 
 		 318 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  66.04 
 
 		 318 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  65.72 
 
 		 318 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  65.72 
 
 		 318 aa  435  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  66.67 
 
 		 318 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  66.67 
 
 		 318 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  65.09 
 
 		 318 aa  412  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  61.64 
 
 		 318 aa  414  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  62.58 
 
 		 318 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  54.14 
 
 		 316 aa  327  1.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  47.06 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  40.38 
 
 		 319 aa  243  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  40.38 
 
 		 319 aa  241  9e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  45.6 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  43.27 
 
 		 313 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  43.15 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  43.63 
 
 		 318 aa  216  5e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  43.63 
 
 		 318 aa  216  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  43.63 
 
 		 318 aa  215  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  41.99 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  41.35 
 
 		 315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  41.35 
 
 		 313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  38.82 
 
 		 316 aa  212  7.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  40.44 
 
 		 315 aa  210  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  42.07 
 
 		 316 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  41.03 
 
 		 313 aa  208  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  39.49 
 
 		 313 aa  206  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  42.07 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  38.56 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1780  auxin efflux carrier  40.48 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0290107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  39.54 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  39.19 
 
 		 295 aa  186  6e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  38.73 
 
 		 319 aa  181  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  39.74 
 
 		 312 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  37.59 
 
 		 313 aa  168  9e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  35.2 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  35.15 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  29.35 
 
 		 310 aa  112  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  29.77 
 
 		 307 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  28.67 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  28.07 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  28.53 
 
 		 350 aa  102  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  27.13 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  27.42 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  30.51 
 
 		 305 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  28.47 
 
 		 310 aa  99.4  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  27.52 
 
 		 306 aa  99.4  8e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  29.56 
 
 		 312 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  28.94 
 
 		 339 aa  96.3  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  32.17 
 
 		 303 aa  96.3  6e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  27.37 
 
 		 336 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  27.89 
 
 		 307 aa  95.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  28.21 
 
 		 336 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  30.94 
 
 		 314 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  28.21 
 
 		 336 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  28.22 
 
 		 309 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  25.99 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  30.58 
 
 		 304 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  29.27 
 
 		 308 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  28.92 
 
 		 315 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  28.77 
 
 		 308 aa  89  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  24.75 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  29.24 
 
 		 311 aa  87  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  26.52 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  28.42 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  26.16 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  25.08 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  26.62 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  23.47 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  28.03 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  25.59 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  27.63 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  22.4 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  27.69 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  26.17 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  27.14 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  29.35 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  25.43 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  26.92 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  27.63 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  29.25 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  25.94 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  24.5 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  25.17 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  26.19 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  27.3 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  30.31 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  24.34 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  23.05 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  27.12 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  25.81 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0404  Auxin Efflux Carrier  24.06 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.989352  normal  0.549528 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  26.05 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  24.76 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  28.24 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>