283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0128 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0128  permease  100 
 
 		 315 aa  615  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  68.57 
 
 		 315 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  68.57 
 
 		 315 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  62.94 
 
 		 314 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  41.39 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  34.6 
 
 		 313 aa  203  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  34.6 
 
 		 309 aa  187  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  34.6 
 
 		 309 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  34.29 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  33.9 
 
 		 325 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  32.78 
 
 		 315 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  32.76 
 
 		 318 aa  153  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  31.37 
 
 		 318 aa  153  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  31.21 
 
 		 312 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  30.89 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  30.72 
 
 		 318 aa  149  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  33.56 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  33.22 
 
 		 318 aa  146  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  33.22 
 
 		 318 aa  146  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  31.74 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  32.69 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  29.56 
 
 		 312 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  29.47 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  29.93 
 
 		 310 aa  129  8.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  29.34 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  29.61 
 
 		 310 aa  119  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  27.6 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  26.65 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  26.03 
 
 		 312 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  29.11 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  27.42 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  31.05 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  31.11 
 
 		 309 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  26.69 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  26.11 
 
 		 350 aa  97.1  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  27.44 
 
 		 321 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  29.01 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  31.39 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  26.58 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  29.69 
 
 		 367 aa  94  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  27.27 
 
 		 337 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 362 aa  93.2  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  27.33 
 
 		 312 aa  92.8  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  25.4 
 
 		 320 aa  92.4  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  25.4 
 
 		 320 aa  92.4  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  27.64 
 
 		 313 aa  92.4  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  29.57 
 
 		 329 aa  91.7  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  27.01 
 
 		 311 aa  92.4  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  25.83 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  28.29 
 
 		 322 aa  90.9  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  24.35 
 
 		 319 aa  89.4  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  26.76 
 
 		 314 aa  89.4  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  30.82 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  26.62 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  26.77 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  29.97 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  26.9 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  27.04 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  24.65 
 
 		 306 aa  87  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  24.44 
 
 		 320 aa  87  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  26.01 
 
 		 314 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  27.04 
 
 		 305 aa  85.9  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  23.9 
 
 		 332 aa  85.5  9e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  24.35 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  28.01 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  27.8 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  27.69 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  27.69 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  27.48 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  26.69 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  25.15 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  25.09 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  27.69 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0268  putative MdcF malonate transporter  28.48 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.359135  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  26.47 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  24.03 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  24.03 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  23.41 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  25.57 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  22.11 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  25.97 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  26.09 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2655  auxin efflux carrier  29.26 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  24.51 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  24.37 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  23.62 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  26.69 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  26.95 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  24.28 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  24.28 
 
 		 320 aa  79  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  26.82 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  25.48 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  24.28 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  24.38 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  25.48 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  25.89 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3529  auxin efflux carrier  26.43 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  25.32 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  28.28 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  26.23 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>