198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2148 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  100 
 
 		 314 aa  613  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  60.95 
 
 		 312 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  58.73 
 
 		 312 aa  350  2e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  58.41 
 
 		 312 aa  348  7e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  49.36 
 
 		 308 aa  282  5.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  50.17 
 
 		 310 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  49.68 
 
 		 310 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  30.99 
 
 		 315 aa  142  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  35.71 
 
 		 311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  31.41 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  29.49 
 
 		 315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  35.71 
 
 		 299 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  32.15 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  29.49 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  33.67 
 
 		 318 aa  123  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  29.34 
 
 		 315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  33.22 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  29.26 
 
 		 324 aa  116  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  31.67 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  28.48 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  29.87 
 
 		 318 aa  105  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  29.25 
 
 		 306 aa  102  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  29.77 
 
 		 312 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  31.01 
 
 		 309 aa  99.4  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  31.01 
 
 		 309 aa  99  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  29.21 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  29.67 
 
 		 318 aa  96.7  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  29.67 
 
 		 318 aa  96.7  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  29.67 
 
 		 318 aa  96.3  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  30.63 
 
 		 322 aa  94  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  30.84 
 
 		 367 aa  92.8  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  30.03 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  30.97 
 
 		 299 aa  90.1  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  29.43 
 
 		 309 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  28.75 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  30.5 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 329 aa  86.3  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  27.63 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  28.34 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  30.15 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  31.71 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  28.8 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  28.8 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  27.39 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  27.3 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  25.97 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  27.67 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  28.71 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  29.34 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  26.42 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  27.65 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  24.68 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  26.05 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  28.25 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  26.17 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  23.87 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  26.05 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  27.74 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  25.94 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  28.8 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  27.1 
 
 		 317 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  28.1 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  23.15 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  28.53 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  29.25 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  27.7 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  25.89 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.16 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49900  permease  28.62 
 
 		 377 aa  62.8  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  24.24 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  27.39 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  23.01 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17720  predicted permease  27.96 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302004  normal  0.264238 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  23.32 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  27.06 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  25.67 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  26.3 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  23.32 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  24.14 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  25.67 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0268  putative MdcF malonate transporter  27.78 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.359135  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  26.89 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  25.57 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  23.71 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  27.76 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  25.41 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  25.89 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  21.98 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  24.91 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  23.51 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  29.15 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  28.68 
 
 		 306 aa  57  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  24.92 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  27.51 
 
 		 311 aa  57  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  22.8 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  22.44 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  28.84 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  25.56 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>