172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1273 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  100 
 
 		 308 aa  600  1.0000000000000001e-171  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  57.01 
 
 		 310 aa  324  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  52.56 
 
 		 312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  51.6 
 
 		 312 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  51.28 
 
 		 312 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  52.14 
 
 		 310 aa  291  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  49.36 
 
 		 314 aa  282  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  32.8 
 
 		 315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  33.12 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  32.36 
 
 		 311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  32.69 
 
 		 315 aa  139  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  32.9 
 
 		 313 aa  139  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  32.9 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  30.48 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  29.32 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  28.22 
 
 		 318 aa  119  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  27.87 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  29.81 
 
 		 324 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  27.18 
 
 		 318 aa  109  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.8 
 
 		 318 aa  109  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  27.21 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.5 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  25.17 
 
 		 318 aa  99.4  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  25.17 
 
 		 318 aa  99.4  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  30.03 
 
 		 313 aa  99  9e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  26.71 
 
 		 306 aa  97.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  28.24 
 
 		 325 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  29.33 
 
 		 314 aa  95.9  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  30.55 
 
 		 313 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  31.72 
 
 		 372 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  26.56 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  28.62 
 
 		 312 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  26.56 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  30.38 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  28.9 
 
 		 308 aa  92.4  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  33.55 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  28.33 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  26.69 
 
 		 320 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  28.66 
 
 		 310 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  24.19 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  27.63 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  28.62 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  26.56 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  29.08 
 
 		 311 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  28.62 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  27.36 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  27.36 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  31.82 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  26.95 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  27.39 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  28.3 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  26 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  26.42 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  27.67 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  27.57 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  28.33 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  26.44 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  24.41 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  28.66 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  27.1 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  27.8 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  28.66 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  27.6 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  25.79 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  27.92 
 
 		 311 aa  67  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  29.64 
 
 		 299 aa  67  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  28.35 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  24.12 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  26.58 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  26.95 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  24.43 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  24.05 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2164  auxin efflux carrier  24.04 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.232164  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  26.02 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.1 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  26.45 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  26.24 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  26.88 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  26.45 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  26.64 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  26.3 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  25.35 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  27.41 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  26.25 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  28.16 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  25.64 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  25.48 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  30.9 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  25.96 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  27.1 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  26.37 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  22.26 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  26.16 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  23.68 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  26.67 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3917  auxin efflux carrier  24.27 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250713  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  22.98 
 
 		 319 aa  55.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>