261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2889 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  100 
 
 		 313 aa  608  1e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  61.59 
 
 		 319 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  61.89 
 
 		 311 aa  344  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  58.28 
 
 		 314 aa  335  7e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  60.13 
 
 		 311 aa  333  3e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  57.33 
 
 		 314 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  57.05 
 
 		 317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  55.41 
 
 		 313 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  53.95 
 
 		 372 aa  279  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  51 
 
 		 311 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  51.67 
 
 		 311 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  50 
 
 		 309 aa  258  8e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  48.18 
 
 		 310 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  45.87 
 
 		 312 aa  245  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  47.56 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  35.35 
 
 		 313 aa  149  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  35.71 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  34.74 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  34.74 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  33.22 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  33.44 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  29.37 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  34.48 
 
 		 317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  31.63 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  30.13 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  30.13 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  29.7 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  32.8 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  30.03 
 
 		 320 aa  126  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  33 
 
 		 320 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  29.04 
 
 		 320 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  35.18 
 
 		 309 aa  126  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  28.71 
 
 		 320 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  30.96 
 
 		 332 aa  125  9e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  31.66 
 
 		 330 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  28.71 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  29.57 
 
 		 319 aa  123  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  30.29 
 
 		 309 aa  124  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  30.29 
 
 		 309 aa  123  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  30.97 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  30.97 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  32.79 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  28.71 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  31.11 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  28.8 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  31.46 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  31.65 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  30.03 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  30.42 
 
 		 361 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  31.12 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  30.67 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  30.62 
 
 		 320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  30.29 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  31.91 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  29.45 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  26.71 
 
 		 313 aa  106  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  28.53 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  29.11 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1014  Auxin Efflux Carrier  32.89 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152875  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  27.81 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  28.71 
 
 		 314 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  30.55 
 
 		 325 aa  102  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  32.08 
 
 		 321 aa  100  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  30.24 
 
 		 306 aa  99.8  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  30.03 
 
 		 308 aa  99  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  27.81 
 
 		 315 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  30.5 
 
 		 340 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  28.25 
 
 		 312 aa  96.3  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  27.74 
 
 		 318 aa  95.5  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  27.74 
 
 		 318 aa  95.5  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  33.33 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.74 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  31.61 
 
 		 318 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  26.37 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  29.45 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  28.35 
 
 		 337 aa  93.6  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  29.68 
 
 		 315 aa  92.8  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  27.59 
 
 		 318 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  27.12 
 
 		 312 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  29.94 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  29.55 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  27.87 
 
 		 326 aa  90.9  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  27.12 
 
 		 312 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  28.53 
 
 		 318 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3917  auxin efflux carrier  33.85 
 
 		 310 aa  90.9  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  27.27 
 
 		 318 aa  90.5  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  29.43 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  28.62 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  28.3 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  30 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.23 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  26.79 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  26.71 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  31.17 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  26.76 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.42 
 
 		 318 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  26.06 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  29.03 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  26.45 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>