261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2179 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  100 
 
 		 308 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  76.95 
 
 		 308 aa  437  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  58.12 
 
 		 306 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  47.73 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  31.73 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  33.55 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  29.22 
 
 		 312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  32.04 
 
 		 311 aa  125  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  29.22 
 
 		 312 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  30.79 
 
 		 318 aa  125  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  30.79 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  30.79 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  29.35 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  29.35 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  29.35 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  27.92 
 
 		 312 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  29.64 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  29.74 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  31.61 
 
 		 318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  27.6 
 
 		 315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  31.49 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  28.77 
 
 		 318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  29.87 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  32.52 
 
 		 310 aa  106  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  27.24 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  30.25 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  30.25 
 
 		 318 aa  103  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  27.12 
 
 		 325 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  26.84 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  29.21 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  25.32 
 
 		 315 aa  95.9  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  24.68 
 
 		 315 aa  95.5  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  28.04 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  28.9 
 
 		 308 aa  92.4  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  28.29 
 
 		 324 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  27.48 
 
 		 316 aa  88.2  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  27.04 
 
 		 367 aa  87.4  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  26.82 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  25.16 
 
 		 320 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  27.21 
 
 		 314 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  27.87 
 
 		 311 aa  85.9  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0231  auxin efflux carrier  32.69 
 
 		 318 aa  85.9  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00153473 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  27.3 
 
 		 314 aa  85.9  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  28.3 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  26.71 
 
 		 329 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  25.41 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  26.2 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  26.37 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  24.44 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  27.76 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  26.56 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  29.22 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  24.12 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  28.43 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  28.43 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  28.09 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  24.76 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  29.37 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  23.64 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  24.21 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  24.44 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  26.76 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  24.76 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  24.44 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  24.59 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  24.5 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  27.13 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  25.99 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  25.31 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  28.33 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0404  Auxin Efflux Carrier  26.51 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.989352  normal  0.549528 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  26.75 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  28.3 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  25.99 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  23.84 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  26.44 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  25.17 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  26.71 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  25.99 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  25.33 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  25.94 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  25.32 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  24.52 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  26.6 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  27.3 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  24.76 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  23.51 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  25.3 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  23.7 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  25.89 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  26.14 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  24.16 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  22.74 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  21.38 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  24.35 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  24.44 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  26.21 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  24.84 
 
 		 310 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>