More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0130 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 318 aa  618  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  97.48 
 
 		 318 aa  608  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  81.45 
 
 		 318 aa  535  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  82.08 
 
 		 318 aa  533  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  75.32 
 
 		 318 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  74.68 
 
 		 318 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  74.68 
 
 		 318 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  31.37 
 
 		 315 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  30.69 
 
 		 315 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  30 
 
 		 315 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  32.26 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  31.92 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  31.68 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  29.39 
 
 		 312 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  31.08 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  29.39 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  33.67 
 
 		 314 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  30.67 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  28.22 
 
 		 308 aa  119  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  30.41 
 
 		 309 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  30.41 
 
 		 309 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  31.91 
 
 		 309 aa  119  9e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  27.91 
 
 		 307 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  30.19 
 
 		 315 aa  117  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  29.25 
 
 		 324 aa  116  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  28.99 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  28.71 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  27.04 
 
 		 313 aa  112  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  31.61 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  28.62 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  30.48 
 
 		 367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  28.9 
 
 		 322 aa  109  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  28.22 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  29.14 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  31.67 
 
 		 315 aa  106  6e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  29.66 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  29.84 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  29.55 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  29.55 
 
 		 342 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  29.31 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 306 aa  99.8  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  28.28 
 
 		 310 aa  99.8  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 316 aa  99.4  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  30.55 
 
 		 309 aa  99  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  29.13 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  30.6 
 
 		 316 aa  97.4  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  28.38 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  28.38 
 
 		 305 aa  96.7  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  30.56 
 
 		 329 aa  96.3  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  29.68 
 
 		 321 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  29.53 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  26.11 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  28.63 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  27.51 
 
 		 314 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  27.36 
 
 		 340 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  27.45 
 
 		 315 aa  90.5  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 313 aa  90.5  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  27.3 
 
 		 306 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  26.69 
 
 		 317 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  25.71 
 
 		 317 aa  89.7  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  26.8 
 
 		 309 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  26.8 
 
 		 309 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  27.67 
 
 		 318 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  28.16 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  30.95 
 
 		 299 aa  89  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  25.08 
 
 		 337 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  24.5 
 
 		 315 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  28.62 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  28.3 
 
 		 318 aa  86.3  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  30.04 
 
 		 311 aa  85.9  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  26.43 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  27.01 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.8 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  25.87 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2077  Auxin Efflux Carrier  26.56 
 
 		 327 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.393578  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  27.5 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  26.26 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2164  auxin efflux carrier  30.67 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.232164  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  27.24 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  29.76 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  27.54 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  27.21 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0231  auxin efflux carrier  30.31 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00153473 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  30.51 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  27.16 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  26.71 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  26.71 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  27.24 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  30.28 
 
 		 304 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  24.41 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  24.17 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  27.51 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  28.9 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  24.83 
 
 		 311 aa  75.9  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  26.1 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7177  Auxin Efflux Carrier  28.81 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  26.32 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  20.69 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>