243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0289 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 
305 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  92.46 
 
 
305 aa  557  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  45.72 
 
 
303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  41.18 
 
 
306 aa  209  6e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  40.97 
 
 
308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  40.07 
 
 
309 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  39.54 
 
 
305 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  38.19 
 
 
310 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  34.68 
 
 
306 aa  183  3e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  41.18 
 
 
304 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  38.33 
 
 
308 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  39.93 
 
 
304 aa  177  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  38.33 
 
 
315 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  38.33 
 
 
305 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  40.21 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  36.48 
 
 
307 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  36.21 
 
 
303 aa  172  5.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  37.11 
 
 
336 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  35.5 
 
 
302 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  38.87 
 
 
311 aa  170  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  37.2 
 
 
310 aa  168  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  38.28 
 
 
308 aa  168  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  35.74 
 
 
339 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  34.97 
 
 
308 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  36.27 
 
 
304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  39.31 
 
 
273 aa  162  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  35.27 
 
 
336 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  35.27 
 
 
336 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  38.08 
 
 
304 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  38.08 
 
 
314 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  41.22 
 
 
300 aa  152  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  37.22 
 
 
315 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  37.58 
 
 
315 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  37.79 
 
 
301 aa  142  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  31 
 
 
310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  34.84 
 
 
297 aa  139  7e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  33.55 
 
 
304 aa  135  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  32.25 
 
 
311 aa  132  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  35.53 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  34.77 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  33.66 
 
 
330 aa  123  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  32.25 
 
 
362 aa  122  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  30.82 
 
 
305 aa  122  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  30.82 
 
 
305 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  32.55 
 
 
350 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  33.56 
 
 
305 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  32.47 
 
 
301 aa  112  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  28.01 
 
 
307 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  33.33 
 
 
312 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  32.08 
 
 
300 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  32.9 
 
 
305 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  27.74 
 
 
319 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3195  auxin efflux carrier  32.05 
 
 
301 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  28.06 
 
 
319 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  25.33 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  25.33 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  25.99 
 
 
318 aa  90.9  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  25.33 
 
 
318 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  25.33 
 
 
318 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  28.81 
 
 
318 aa  90.1  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  24.84 
 
 
318 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  24.84 
 
 
318 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  24.84 
 
 
318 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  26.56 
 
 
315 aa  89.7  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  27.81 
 
 
313 aa  89.4  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  24.84 
 
 
318 aa  89.4  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  25.33 
 
 
318 aa  89  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  24.75 
 
 
330 aa  87.8  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2655  auxin efflux carrier  31.68 
 
 
332 aa  87  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  24.6 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  25.33 
 
 
318 aa  84  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  23.28 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  24.67 
 
 
316 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  26.13 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  25.66 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  23.61 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  23.61 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  27.21 
 
 
318 aa  80.5  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  25.42 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.33 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  28.19 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  26.23 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  27.45 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  28.19 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  26.92 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  28.21 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  23.86 
 
 
316 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  28.52 
 
 
318 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  27.51 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  25.91 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.41 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  27.88 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  23.47 
 
 
308 aa  77  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  26.88 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  22.07 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  25.5 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  25.5 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  26.23 
 
 
315 aa  75.9  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  27.15 
 
 
316 aa  75.5  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  27.55 
 
 
315 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>