196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2979 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  100 
 
 		 309 aa  598  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  99.68 
 
 		 309 aa  597  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  95.47 
 
 		 309 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  69.81 
 
 		 325 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  50.65 
 
 		 313 aa  265  7e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  34.6 
 
 		 315 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  35.56 
 
 		 315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  35.87 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  36.15 
 
 		 315 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  37.63 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  32.57 
 
 		 314 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  34.9 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  31.02 
 
 		 312 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  30.23 
 
 		 312 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  30.23 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  30.29 
 
 		 313 aa  123  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  29.35 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  29.9 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  32.47 
 
 		 310 aa  119  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  30.07 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  30.74 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  29.54 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  29.07 
 
 		 311 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  28.2 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  29.18 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  27.56 
 
 		 305 aa  99.8  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  28.76 
 
 		 309 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  31.01 
 
 		 314 aa  99  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  26.92 
 
 		 306 aa  97.4  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  26.21 
 
 		 308 aa  97.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  28.15 
 
 		 313 aa  96.7  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  25.72 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  26.56 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  29.87 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  29.87 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  26.21 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  29.01 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  30.82 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  26.8 
 
 		 318 aa  89.4  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  26.07 
 
 		 314 aa  89  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  27.95 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  25.26 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  25.26 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.26 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  28.01 
 
 		 310 aa  87  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  31.16 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  26.86 
 
 		 318 aa  87  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  27.33 
 
 		 318 aa  86.7  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  25.33 
 
 		 320 aa  85.9  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  25.33 
 
 		 320 aa  86.3  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  28.05 
 
 		 306 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 320 aa  85.9  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  28.9 
 
 		 329 aa  85.9  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  29.49 
 
 		 309 aa  85.5  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  27.81 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  24.58 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  24.92 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  24.53 
 
 		 332 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  25.8 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  23.1 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  24.67 
 
 		 320 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  27.81 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  29.58 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  27.81 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  30.13 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  29.04 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  29.34 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  26.2 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  24.75 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  30.08 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  28.44 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  27.1 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  26.9 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  21.97 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  27.87 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49900  permease  30.77 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  27.21 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  24.61 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  27.33 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  23.7 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  27.91 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  28.34 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  29.21 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  25.49 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  25.93 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  26.2 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  27.8 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  28.87 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  22.8 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  29.34 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  25.32 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  28.85 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  29.39 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  24.05 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  28.85 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  29.25 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  25.34 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  29.39 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>