285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3450 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  100 
 
 		 307 aa  595  1e-169  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  66.45 
 
 		 313 aa  401  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  66.78 
 
 		 311 aa  376  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  63.19 
 
 		 309 aa  363  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  62.21 
 
 		 309 aa  358  5e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  62.21 
 
 		 309 aa  358  5e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  56.35 
 
 		 309 aa  337  9.999999999999999e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  34.77 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  33.44 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  36.13 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  36.84 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  35.28 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  34.44 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  32.47 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  35.99 
 
 		 330 aa  135  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  32.17 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  31.21 
 
 		 312 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  30.94 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  35.74 
 
 		 309 aa  125  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  33.22 
 
 		 311 aa  122  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  27.91 
 
 		 318 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  28.9 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  27.72 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  31.6 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  30.36 
 
 		 313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  34.52 
 
 		 337 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  31.01 
 
 		 361 aa  116  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  28.01 
 
 		 318 aa  115  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  30.82 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  32.35 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  33.75 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  28.86 
 
 		 309 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  28.81 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.94 
 
 		 318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  26.6 
 
 		 318 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  26.6 
 
 		 318 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  30.82 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  28.34 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  30.69 
 
 		 311 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  29.29 
 
 		 314 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  29.84 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  28.39 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  28.9 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  30.72 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  28.62 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  28.62 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  31.06 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  26.54 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  29.17 
 
 		 317 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  30.13 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  27.36 
 
 		 319 aa  99  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  31.39 
 
 		 372 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  27.36 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  27.71 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  29.17 
 
 		 340 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  27.62 
 
 		 315 aa  95.9  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  29.58 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  28.71 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  25.39 
 
 		 320 aa  91.7  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  29.77 
 
 		 317 aa  89.4  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  35.96 
 
 		 305 aa  89  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  25.31 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  29.33 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  24.53 
 
 		 320 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  25 
 
 		 320 aa  85.9  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1197  auxin efflux carrier  27.56 
 
 		 322 aa  85.9  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.793167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  29.04 
 
 		 309 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  31.01 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  25.7 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  29.04 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  25 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  26.81 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0268  putative MdcF malonate transporter  30.28 
 
 		 321 aa  84  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.359135  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  29.61 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  26.32 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  27.43 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49900  permease  31.48 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7177  Auxin Efflux Carrier  27.33 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  29.04 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  24.76 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  26.69 
 
 		 315 aa  79  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  27.57 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  29.14 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  27.42 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  25.57 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  26.37 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2164  auxin efflux carrier  29.93 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.232164  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  27.24 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  28.57 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  30.43 
 
 		 309 aa  75.5  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  25.79 
 
 		 315 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  26.14 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  28.44 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  31.35 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  28.62 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  25.16 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  27.93 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  27.85 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>