151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0325 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  100 
 
 		 361 aa  690    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  57.66 
 
 		 330 aa  360  2e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  54.39 
 
 		 330 aa  327  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  52.84 
 
 		 318 aa  306  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  52.84 
 
 		 318 aa  305  7e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  52.71 
 
 		 316 aa  301  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  53.93 
 
 		 337 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  52.14 
 
 		 321 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  35.2 
 
 		 313 aa  155  8e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  35.07 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  32.69 
 
 		 311 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  32.95 
 
 		 307 aa  125  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  34.46 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  33.52 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  33.52 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  30.42 
 
 		 313 aa  116  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  28.53 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  30.08 
 
 		 319 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  29.01 
 
 		 320 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  29.3 
 
 		 320 aa  97.1  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  29.31 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  32.63 
 
 		 311 aa  96.3  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  30.39 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  28.86 
 
 		 314 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  29.39 
 
 		 320 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  27.11 
 
 		 314 aa  93.6  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  31.1 
 
 		 311 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  27.02 
 
 		 318 aa  93.2  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  32.22 
 
 		 337 aa  92.8  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  33.71 
 
 		 309 aa  92.4  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  27.56 
 
 		 319 aa  90.9  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  30.08 
 
 		 311 aa  90.9  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  27.53 
 
 		 315 aa  89.7  8e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  30.14 
 
 		 311 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  28.81 
 
 		 320 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  29.34 
 
 		 311 aa  87  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  30.11 
 
 		 340 aa  86.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  29.44 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  29.25 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  28.41 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  28.12 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  28.12 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  27.93 
 
 		 313 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  30.17 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  28.21 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  27.73 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  28.12 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  26.96 
 
 		 320 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  28.88 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  30.42 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  29.85 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  27.43 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  29.38 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  29.18 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  28.16 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  27.58 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2164  auxin efflux carrier  26.39 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.232164  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  25.7 
 
 		 317 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  29 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  27.87 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7177  Auxin Efflux Carrier  26.39 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  28.18 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  29.86 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  25.87 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3917  auxin efflux carrier  34.23 
 
 		 310 aa  72.4  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  26.29 
 
 		 322 aa  72  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  28.73 
 
 		 312 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  25.56 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  26.82 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  27.79 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  27.91 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  27.55 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  25.23 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49900  permease  29.05 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  25.21 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  28.22 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  28.25 
 
 		 314 aa  67  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  26.63 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  29.48 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  27.2 
 
 		 372 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  29.3 
 
 		 315 aa  65.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  27.87 
 
 		 313 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  27.42 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  25.07 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  25.07 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.07 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02282  predicted transporter  25.87 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2509  putative transporter YfdV  25.87 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.122299  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  26.93 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02243  hypothetical protein  25.87 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  26.56 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  26.22 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  25.22 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  24.78 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  26.54 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  28.53 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  26.51 
 
 		 310 aa  59.3  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  26.59 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  26.59 
 
 		 309 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  28.53 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>