257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2420 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 317 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  57.05 
 
 		 313 aa  322  4e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  55.31 
 
 		 319 aa  317  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  56.73 
 
 		 311 aa  311  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  52.24 
 
 		 314 aa  297  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  52.12 
 
 		 314 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  55.77 
 
 		 311 aa  296  4e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  53.53 
 
 		 313 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  52.06 
 
 		 372 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  46.82 
 
 		 311 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  45.42 
 
 		 311 aa  235  6e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  45.97 
 
 		 309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  45.16 
 
 		 311 aa  232  7.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  42.72 
 
 		 312 aa  228  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  44.34 
 
 		 310 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  32.09 
 
 		 322 aa  139  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  29.41 
 
 		 322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  32.48 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  31.86 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  31.95 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  30.35 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  31.03 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  30.57 
 
 		 313 aa  123  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  32.8 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  29.47 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  28.24 
 
 		 320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  27.91 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  31.33 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  34.63 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  32.36 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  34.63 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  28.81 
 
 		 320 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  27.57 
 
 		 320 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  31.29 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  27.42 
 
 		 320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  32.7 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  31.46 
 
 		 309 aa  109  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  27.42 
 
 		 319 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  27.42 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  27.42 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  27.61 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  29.97 
 
 		 320 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  30.45 
 
 		 313 aa  105  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  31.58 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  28.66 
 
 		 320 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  31.37 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7177  Auxin Efflux Carrier  31.51 
 
 		 322 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  31.25 
 
 		 340 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  30.89 
 
 		 318 aa  96.7  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  30.34 
 
 		 330 aa  96.7  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  28.08 
 
 		 309 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  29.73 
 
 		 309 aa  96.3  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  29.69 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  28.95 
 
 		 347 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  29.34 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  30.55 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  28.57 
 
 		 318 aa  93.6  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  30.74 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1197  auxin efflux carrier  25.16 
 
 		 322 aa  92.8  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.793167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  28.25 
 
 		 318 aa  92.4  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  31.48 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  28.12 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  26.32 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  28.12 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  27.46 
 
 		 337 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  28.77 
 
 		 306 aa  90.1  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  29.27 
 
 		 315 aa  90.1  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  26.47 
 
 		 312 aa  89.7  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  27.59 
 
 		 314 aa  89.7  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1014  Auxin Efflux Carrier  29.83 
 
 		 306 aa  89.4  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152875  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  26.47 
 
 		 312 aa  89.4  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  26.28 
 
 		 318 aa  89  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.01 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  28.66 
 
 		 330 aa  88.6  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  29.64 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  27.96 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  26.69 
 
 		 318 aa  87  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  26.69 
 
 		 318 aa  87  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  27.91 
 
 		 314 aa  86.3  6e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  27.87 
 
 		 316 aa  86.3  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.25 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.28 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  26.71 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  27.59 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  27.36 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  25.9 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  30.04 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2219  Auxin Efflux Carrier  30.09 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  29.81 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  28.09 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  31.4 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  27.19 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  24.04 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3295  Auxin Efflux Carrier  27.46 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  28.47 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  24.04 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  30.65 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  26.5 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  26.73 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  30.27 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>