229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2510 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  100 
 
 		 309 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  100 
 
 		 309 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  87.06 
 
 		 309 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  69.93 
 
 		 313 aa  412  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  68.4 
 
 		 311 aa  376  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  63.84 
 
 		 309 aa  360  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  62.21 
 
 		 307 aa  358  6e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  40.31 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  37.15 
 
 		 330 aa  152  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  33.87 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  38.54 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  38.22 
 
 		 318 aa  142  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  34.74 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  33.44 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  33.22 
 
 		 320 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  30.89 
 
 		 312 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  34.22 
 
 		 311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  32.59 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  33.33 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  37.07 
 
 		 321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  33.77 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  31.77 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  35.15 
 
 		 330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  32.01 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  31.37 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  31.85 
 
 		 340 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  31.33 
 
 		 317 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  30.74 
 
 		 318 aa  122  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  35.1 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  34.88 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  30.35 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  31.65 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  35.63 
 
 		 337 aa  119  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  32.13 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  29.64 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  32.48 
 
 		 311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  33.98 
 
 		 317 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  33.55 
 
 		 309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  30.07 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  32.04 
 
 		 309 aa  112  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  31.52 
 
 		 361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  31.37 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  31.96 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  33.44 
 
 		 372 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  30.84 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  33.22 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  30.74 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  31.05 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  31.13 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  30.45 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  26.93 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  30.52 
 
 		 315 aa  99.8  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  29.87 
 
 		 309 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  30.18 
 
 		 325 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  29.53 
 
 		 309 aa  99  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  28.31 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.87 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  26.69 
 
 		 322 aa  97.1  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  29.91 
 
 		 317 aa  95.9  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  27.21 
 
 		 318 aa  95.9  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  32.26 
 
 		 316 aa  95.9  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  27.21 
 
 		 318 aa  95.9  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7177  Auxin Efflux Carrier  31.07 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2164  auxin efflux carrier  34.92 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.232164  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  27.3 
 
 		 320 aa  93.2  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  31.97 
 
 		 306 aa  93.2  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  30.33 
 
 		 337 aa  92.8  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  27.3 
 
 		 320 aa  92.8  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  27.39 
 
 		 322 aa  91.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  26.69 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  25.65 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  27.85 
 
 		 315 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  26.79 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  29.49 
 
 		 305 aa  87  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  27.36 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  28.04 
 
 		 325 aa  86.7  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  27.48 
 
 		 320 aa  86.7  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  30.51 
 
 		 309 aa  85.9  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  28.95 
 
 		 322 aa  85.9  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  28.53 
 
 		 313 aa  85.9  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  26.48 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  31.56 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  27.01 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  27.04 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  28.85 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  25.24 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49900  permease  32.55 
 
 		 377 aa  82.8  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  28.76 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  27.48 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  29.3 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  28.76 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  26.35 
 
 		 312 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  27.71 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  27.97 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  30.35 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  25.08 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  27.91 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  24.84 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  25 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  28.89 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>