268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3839 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  100 
 
 		 313 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  50.65 
 
 		 309 aa  266  4e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  50.65 
 
 		 309 aa  265  7e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  49.35 
 
 		 309 aa  260  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  47.46 
 
 		 325 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  43.42 
 
 		 311 aa  225  9e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  35.99 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  37.14 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  37.46 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  34.6 
 
 		 315 aa  203  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  37.62 
 
 		 315 aa  196  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  35.22 
 
 		 324 aa  169  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  33.65 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  33.65 
 
 		 312 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  35.35 
 
 		 313 aa  149  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  32.38 
 
 		 312 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  32.9 
 
 		 308 aa  139  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  34.44 
 
 		 310 aa  135  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  31.91 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  31.41 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  31.03 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  33.64 
 
 		 319 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  30.82 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  31.39 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  28.81 
 
 		 318 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  35.45 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  28.81 
 
 		 318 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.81 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  29.64 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  27.04 
 
 		 318 aa  112  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  30.13 
 
 		 314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  31.89 
 
 		 309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  28.01 
 
 		 318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  31.02 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  32.55 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  31.94 
 
 		 372 aa  109  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  30.77 
 
 		 367 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  26.71 
 
 		 318 aa  109  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  32.68 
 
 		 313 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  30.45 
 
 		 310 aa  106  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  28.15 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  29.06 
 
 		 320 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  27.04 
 
 		 318 aa  105  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  27.8 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  28.57 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  32.68 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  29.47 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  28.79 
 
 		 321 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  28.75 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  28.8 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  29.71 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  29.37 
 
 		 309 aa  100  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  29.87 
 
 		 306 aa  100  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  27.02 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  31.13 
 
 		 309 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  31.13 
 
 		 309 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  30.27 
 
 		 320 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  30.27 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  30.27 
 
 		 320 aa  95.9  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  29.07 
 
 		 311 aa  95.5  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  29.93 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  29.56 
 
 		 317 aa  93.6  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  28.47 
 
 		 309 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  28.81 
 
 		 322 aa  92.8  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  28.21 
 
 		 315 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2077  Auxin Efflux Carrier  27.62 
 
 		 327 aa  92.4  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.393578  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  26.92 
 
 		 332 aa  91.7  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  30.13 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  28.25 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  31.78 
 
 		 342 aa  92  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  31.78 
 
 		 342 aa  91.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  27.1 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  28.14 
 
 		 320 aa  89.7  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  28.14 
 
 		 320 aa  89.7  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  25.56 
 
 		 318 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  29.67 
 
 		 309 aa  89  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  28.81 
 
 		 320 aa  89.4  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  27.27 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  26.45 
 
 		 320 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  29.81 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  28.19 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  28.46 
 
 		 313 aa  87  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49900  permease  30.82 
 
 		 377 aa  87  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  30.49 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  32.59 
 
 		 315 aa  86.3  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  27.93 
 
 		 319 aa  86.3  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  30.41 
 
 		 318 aa  85.9  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  23.75 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  26.47 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  31.73 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  29.43 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  29.2 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  28.08 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  30.09 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  28.57 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  24.12 
 
 		 306 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  27.24 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  31.38 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  24.84 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  28.48 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>