142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7177 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7177  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 
322 aa  610  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  48.26 
 
 
317 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  47.91 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  48.06 
 
 
318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  47.6 
 
 
340 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  46.33 
 
 
317 aa  248  7e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  45.34 
 
 
318 aa  248  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  43.45 
 
 
320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  42.99 
 
 
320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  44.27 
 
 
320 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  32.49 
 
 
309 aa  113  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  31.46 
 
 
309 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  30.42 
 
 
311 aa  109  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  32.01 
 
 
314 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  30.03 
 
 
313 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  32.01 
 
 
314 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  29.97 
 
 
318 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  29.81 
 
 
312 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  29.97 
 
 
315 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  29.97 
 
 
318 aa  99.8  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  33.01 
 
 
310 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  30.72 
 
 
311 aa  99.4  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  27.71 
 
 
311 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  30.63 
 
 
330 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  33.56 
 
 
309 aa  96.7  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  31.46 
 
 
311 aa  96.3  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  30.87 
 
 
309 aa  95.9  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  30.87 
 
 
309 aa  95.9  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  30.23 
 
 
317 aa  95.5  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  33.11 
 
 
313 aa  93.2  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  26.86 
 
 
330 aa  92.8  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  28.62 
 
 
316 aa  89.7  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  28.9 
 
 
307 aa  89.4  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  31.03 
 
 
321 aa  88.2  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  28.47 
 
 
309 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  29.43 
 
 
337 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  28.9 
 
 
313 aa  87  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  29.83 
 
 
318 aa  87  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  30.16 
 
 
319 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  25 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  29.49 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  29.15 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  26.67 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  30.06 
 
 
311 aa  80.1  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  29.73 
 
 
337 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  28.26 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2164  auxin efflux carrier  28.62 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.232164  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  24.1 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  27.72 
 
 
311 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  23.9 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  24.1 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  27.3 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  24.1 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49900  permease  32.9 
 
 
377 aa  75.9  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  25.8 
 
 
322 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  26.6 
 
 
315 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  24.1 
 
 
320 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0404  Auxin Efflux Carrier  30.26 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.989352  normal  0.549528 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  33.12 
 
 
316 aa  75.1  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.93 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  25.59 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  25.59 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  22.78 
 
 
319 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  27.87 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  30.23 
 
 
372 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  25.52 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  24.07 
 
 
320 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  22.58 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  25.76 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  29.69 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  27.01 
 
 
324 aa  70.1  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  23.66 
 
 
320 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  26.49 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  22.93 
 
 
320 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  22.93 
 
 
320 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  28.21 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  27.21 
 
 
311 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  27.1 
 
 
317 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3917  auxin efflux carrier  28.5 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250713  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  25.55 
 
 
361 aa  66.6  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  29.35 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  24.53 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  27.04 
 
 
309 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  28.9 
 
 
329 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  27.24 
 
 
315 aa  63.9  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  23.34 
 
 
315 aa  62.4  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  27.27 
 
 
309 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  27.27 
 
 
309 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2607  auxin efflux carrier  26.67 
 
 
319 aa  60.5  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10012  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  26.32 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  26.89 
 
 
305 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  26.75 
 
 
315 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  27.78 
 
 
322 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  27.36 
 
 
312 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  25.39 
 
 
315 aa  56.6  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2077  Auxin Efflux Carrier  29.08 
 
 
327 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.393578  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  24.54 
 
 
315 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  27.53 
 
 
312 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  28.03 
 
 
312 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1197  auxin efflux carrier  24.25 
 
 
322 aa  55.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.793167  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>